More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4356 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
205 aa  420  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  40.99 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0573  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.35 
 
 
219 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210533  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  36.67 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3641  Glutathione S-transferase domain protein  37.73 
 
 
218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  37.21 
 
 
221 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_004310  BR0951  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2238  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.66 
 
 
206 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1170  glutathione S-transferase  37.26 
 
 
217 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27755  glutathione S-transferase  35.18 
 
 
206 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2427  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.79 
 
 
219 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340237  normal  0.0428234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0769  glutathione S-transferase  38.79 
 
 
219 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608104  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7686  glutathione S-transferase-like protein  31.82 
 
 
214 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474064  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  30.3 
 
 
214 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.3 
 
 
214 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.8 
 
 
214 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1887  Glutathione S-transferase domain protein  36.05 
 
 
206 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1834  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.74 
 
 
219 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.14 
 
 
205 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  36.45 
 
 
186 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  36.45 
 
 
186 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  34.67 
 
 
206 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.13 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  35.61 
 
 
201 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  35.92 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3602  Glutathione S-transferase domain  32 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383025  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  35.12 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0742  Glutathione S-transferase domain protein  33.9 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  31.55 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.09 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.65 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  36.72 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1679  Glutathione S-transferase domain protein  28.86 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000555439  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  35.71 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  33 
 
 
213 aa  91.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1946  Glutathione S-transferase domain protein  27.78 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.243361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1508  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1148  Glutathione S-transferase protein  32 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  32 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4438  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0845  Glutathione S-transferase domain  30.14 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00564189  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  30.43 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0914  Glutathione S-transferase domain protein  30.14 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0984  gst-related protein  31.11 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149147  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3556  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  33.95 
 
 
216 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 
221 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  34.98 
 
 
204 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0966  glutathione S-transferase family protein  28.43 
 
 
208 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.36 
 
 
213 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  32.52 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1014  glutathione S-transferase family protein  28.43 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0683472  normal  0.818596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0995  glutathione S-transferase family protein  28.43 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.80831  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0898  glutathione S-transferase family protein  28.43 
 
 
208 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3856  glutathione S-transferase family protein  31 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.65 
 
 
207 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0277  Glutathione S-transferase domain  32.11 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  34.36 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  31.6 
 
 
223 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  30.29 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.99 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3560  Glutathione S-transferase domain  34 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.945145  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1629  glutathione S-transferase  32.51 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.197221  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3002  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.36 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.404999  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  34.48 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.06 
 
 
222 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.83 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.48 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  31.61 
 
 
216 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  28.21 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 
222 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0934  glutathione S-transferase family protein  27.94 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
204 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 
222 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.67 
 
 
222 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  30.67 
 
 
222 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.67 
 
 
222 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4182  glutathione S-transferase-like protein  33.17 
 
 
227 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.645028  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  33.33 
 
 
218 aa  84.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1329  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.92 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.630065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.15 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.48 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.66 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  36.17 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1504  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.5 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3417  glutathione S-transferase, putative  34.41 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0270497  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0387  glutathione S-transferase-like  31.25 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1469  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.35 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3227  Glutathione S-transferase domain  33.74 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.805689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>