More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0966 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0966  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 
208 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0898  glutathione S-transferase family protein  99.04 
 
 
208 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0995  glutathione S-transferase family protein  99.04 
 
 
208 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.80831  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0934  glutathione S-transferase family protein  99.04 
 
 
208 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1014  glutathione S-transferase family protein  98.56 
 
 
208 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0683472  normal  0.818596 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0864  glutathione S-transferase family protein  82.21 
 
 
208 aa  341  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00805  predicted glutathione S-transferase  82.21 
 
 
208 aa  341  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2804  Glutathione S-transferase domain protein  82.21 
 
 
208 aa  341  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0908  glutathione S-transferase family protein  82.21 
 
 
208 aa  341  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0990  glutathione S-transferase family protein  82.21 
 
 
208 aa  341  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.472621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2804  glutathione S-transferase domain-containing protein  82.21 
 
 
208 aa  341  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00822  hypothetical protein  82.21 
 
 
208 aa  341  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0899  glutathione S-transferase family protein  81.73 
 
 
208 aa  337  7e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.717795  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1329  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.96 
 
 
208 aa  334  7e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.630065 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2508  glutathione S-transferase family protein  81.05 
 
 
192 aa  325  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.122319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1679  Glutathione S-transferase domain protein  58.17 
 
 
205 aa  255  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000555439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1946  Glutathione S-transferase domain protein  58.17 
 
 
205 aa  254  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.243361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2300  Glutathione S-transferase domain protein  56.73 
 
 
205 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2400  Glutathione S-transferase domain protein  55.29 
 
 
205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1542  putative glutathione S-transferase  51.44 
 
 
206 aa  226  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2665  putative glutathione S-transferase  51.44 
 
 
206 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2747  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.44 
 
 
206 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1623  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.92 
 
 
206 aa  221  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.012281 
 
 
-
 
NC_004310  BR0951  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.96 
 
 
206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  50 
 
 
206 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27755  glutathione S-transferase  48.08 
 
 
206 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4182  glutathione S-transferase-like protein  46.89 
 
 
227 aa  205  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.645028  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1504  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.89 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2238  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.63 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237736  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3856  glutathione S-transferase family protein  45.45 
 
 
207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1629  glutathione S-transferase  45.93 
 
 
207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.197221  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3602  Glutathione S-transferase domain  44.71 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383025  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1469  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.45 
 
 
207 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1894  glutathione S-transferase family protein  44.5 
 
 
207 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3821  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.5 
 
 
207 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7686  glutathione S-transferase-like protein  43.48 
 
 
214 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474064  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  43 
 
 
214 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  43 
 
 
214 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3556  Glutathione S-transferase domain protein  43.96 
 
 
215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.55 
 
 
214 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4895  Glutathione S-transferase domain  45.24 
 
 
208 aa  177  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.123273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  43.81 
 
 
208 aa  174  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  43.54 
 
 
213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3352  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.29 
 
 
208 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148422  hitchhiker  0.0000403309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2514  glutathione S-transferase-like protein  40.38 
 
 
214 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225019  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0742  Glutathione S-transferase domain protein  41.98 
 
 
213 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0914  Glutathione S-transferase domain protein  40.38 
 
 
213 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0845  Glutathione S-transferase domain  40.38 
 
 
213 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00564189  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2784  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.58 
 
 
220 aa  168  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0350061  hitchhiker  0.000562262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0984  gst-related protein  39.91 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149147  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3002  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.48 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.404999  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0239  glutathione S-transferase-like protein  43.81 
 
 
209 aa  165  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.361263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  42.86 
 
 
207 aa  164  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4241  glutathione S-transferase-like  40.89 
 
 
206 aa  164  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3227  Glutathione S-transferase domain  43 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.805689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3730  glutathione S-transferase-like  41.35 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4438  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 
206 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1487  glutathione S-transferase  40.39 
 
 
212 aa  158  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1887  Glutathione S-transferase domain protein  39.9 
 
 
206 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1994  glutathione S-transferase-like  42.03 
 
 
201 aa  151  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418655  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2351  glutathione S-transferase  39.91 
 
 
214 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1609  glutathione S-transferase-like protein  39.42 
 
 
216 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1699  glutathione S-transferase family protein  39.42 
 
 
218 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1508  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.62 
 
 
211 aa  148  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2741  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.38 
 
 
203 aa  147  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1987  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.05 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2684  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.48 
 
 
203 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0376  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.4 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.411138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2053  putative glutathione S-transferase  38.32 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70347  normal  0.153383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1148  Glutathione S-transferase protein  35.44 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2218  Glutathione S-transferase domain  38.5 
 
 
213 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3395  putative glutathione S-transferase  37.5 
 
 
207 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40070  putative glutathione S-transferase  37.5 
 
 
207 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151976  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4793  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.13 
 
 
207 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0203  glutathione S-transferase-like protein  37.13 
 
 
207 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
207 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.948185  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1819  Glutathione S-transferase domain protein  36.5 
 
 
207 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.820795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2536  glutathione S-transferase family protein  32.84 
 
 
207 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.869863  normal  0.0380869 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0014  glutathione S-transferase  36.76 
 
 
207 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0018  glutathione S-transferase  36.76 
 
 
207 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1521  glutathione S-transferase  36.76 
 
 
207 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0017  glutathione S-transferase family protein  36.76 
 
 
207 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1443  glutathione S-transferase  36.76 
 
 
207 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1164  glutathione S-transferase  36.76 
 
 
207 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5335  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.63 
 
 
207 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222761  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0019  glutathione S-transferase family protein  36.76 
 
 
207 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2021  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 
207 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0016  glutathione S-transferase  37 
 
 
207 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4710  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.82 
 
 
207 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131353  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2953  glutathione S-transferase-like  36.95 
 
 
194 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.814098  hitchhiker  0.000568326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1177  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.61 
 
 
207 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.902666  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2200  putative glutathione S-transferase-like protein  34.33 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801388  hitchhiker  0.00721495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2072  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165134  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4821  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.16 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62479  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2499  glutathione S-transferase  33.5 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5448  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.16 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5413  glutathione S-transferase-like  34.16 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2009  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500519  normal  0.375789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4777  glutathione S-transferase family protein  33.83 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.12 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0807444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>