More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0508 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
213 aa  441  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  45.24 
 
 
222 aa  175  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1148  glutathione S-transferase-like  41.09 
 
 
219 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.09 
 
 
217 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.41 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  34.83 
 
 
216 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  35.82 
 
 
216 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  34.86 
 
 
216 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  34.67 
 
 
224 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  35.35 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  35.82 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  34.48 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  34.16 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  34.34 
 
 
219 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  35.47 
 
 
225 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.51 
 
 
205 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.39 
 
 
220 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.31 
 
 
221 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  31.16 
 
 
214 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  30.52 
 
 
222 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  30.52 
 
 
222 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.99 
 
 
205 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  30.73 
 
 
214 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  32.5 
 
 
208 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
222 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 
207 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 
208 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  33.51 
 
 
205 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.67 
 
 
232 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  31.22 
 
 
205 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  33.5 
 
 
214 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.96 
 
 
205 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.25 
 
 
222 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  33.5 
 
 
215 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  30.99 
 
 
225 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  31.22 
 
 
232 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  34.13 
 
 
201 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 
210 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.6 
 
 
233 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  31.6 
 
 
233 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.6 
 
 
233 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  31.94 
 
 
232 aa  101  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  30.05 
 
 
222 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  31.19 
 
 
201 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.35 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  32.67 
 
 
208 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  31.19 
 
 
201 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  31.82 
 
 
229 aa  98.2  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  28.71 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.09 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  30.66 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  34.11 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  29.11 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  32 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  31.58 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  32.18 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  31.5 
 
 
198 aa  95.5  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 
221 aa  95.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  32.51 
 
 
198 aa  94.7  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.19 
 
 
222 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  30 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  31.84 
 
 
226 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  29.67 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  29.58 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.06 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.72 
 
 
222 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.5 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  28.64 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  28.16 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  30.85 
 
 
186 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  30.85 
 
 
186 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.72 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  32.16 
 
 
215 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  31.79 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  32.57 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  30.41 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  29.63 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  29.67 
 
 
221 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.62 
 
 
207 aa  88.6  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  29.59 
 
 
181 aa  88.2  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.36 
 
 
205 aa  88.2  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  33.49 
 
 
209 aa  88.2  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.06 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  28.28 
 
 
223 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.07 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.91 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  32.21 
 
 
208 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  29.7 
 
 
208 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8292  Glutathione S-transferase domain protein  32.98 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  33.5 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  29.91 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  28 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  27.57 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>