More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2853 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  99.02 
 
 
204 aa  413  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  96.55 
 
 
204 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  95.07 
 
 
204 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  95.07 
 
 
204 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  94.58 
 
 
204 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  93.1 
 
 
204 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.48 
 
 
205 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.11 
 
 
207 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  43.22 
 
 
201 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  37.63 
 
 
198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  38.14 
 
 
198 aa  134  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  35.64 
 
 
213 aa  121  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.69 
 
 
203 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 
211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  34.74 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  36.32 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.47 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  35.53 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  34.21 
 
 
215 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  35.38 
 
 
207 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  34.33 
 
 
214 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.42 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.61 
 
 
219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  36.76 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.61 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.42 
 
 
227 aa  104  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.9 
 
 
211 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  37.5 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  31.25 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  30.5 
 
 
206 aa  94  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0407  glutathione S-transferase  30.81 
 
 
197 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  27.23 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2345  glutathione S-transferase, putative  35.19 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3374  putative glutathione S-transferase  35.19 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0444471  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3417  glutathione S-transferase, putative  35.19 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0270497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1119  putative glutathione S-transferase  35.19 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  35.8 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2523  putative glutathione S-transferase  35.19 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0257  putative glutathione S-transferase  35.19 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3410  putative glutathione S-transferase  35.19 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  30.39 
 
 
208 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  31.03 
 
 
186 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  31.03 
 
 
186 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.08 
 
 
202 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  32.43 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  31.63 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  29.74 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.95 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  31.79 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  32.43 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  30.43 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.89 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  30.92 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  28.57 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2600  glutathione S-transferase  31.53 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.465574 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  29.44 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  30.41 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  28.57 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5133  Glutathione S-transferase domain  33.94 
 
 
233 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  34.94 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  29.52 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  34.94 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  30.05 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.14 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0862  putative glutathione S-transferase  32.85 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0195921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  31.77 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  33.5 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  34.34 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  29.23 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.59 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  27.92 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  29.38 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  32.02 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2823  glutathione S-transferase  31 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.8 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  30.59 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  29.65 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.45 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  29.39 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6162  Glutathione S-transferase domain  32.1 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2769  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  23.67 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  27.62 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.19 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  30.45 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.67 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>