More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4891 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4891  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0789  Glutathione S-transferase domain  82.71 
 
 
216 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1077  Glutathione S-transferase domain protein  81.31 
 
 
216 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147439  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1469  glutathione S-transferase-like  80.09 
 
 
217 aa  349  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0079  glutathione S-transferase-like  77.83 
 
 
221 aa  336  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0926  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.17 
 
 
217 aa  331  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.017472  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2824  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.43 
 
 
216 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5781  Glutathione S-transferase domain protein  70.75 
 
 
217 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3950  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.19 
 
 
227 aa  292  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3560  Glutathione S-transferase domain  63.38 
 
 
213 aa  281  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.945145  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5865  glutathione S-transferase-like protein  69.7 
 
 
166 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  45.54 
 
 
214 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0016  glutathione S-transferase-like protein  43.33 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0486825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0966  glutathione S-transferase domain-containing protein  43 
 
 
219 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2883  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.9 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527212  normal  0.219041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.93 
 
 
210 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0033  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.71 
 
 
216 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8292  Glutathione S-transferase domain protein  38.79 
 
 
213 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.91 
 
 
212 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562576  normal  0.573525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1407  Glutathione S-transferase domain protein  38.03 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0606838  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.17 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00883028  normal  0.988624 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3111  putative glutathione S-transferase  39.17 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2579  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.92 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.983145  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2245  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5257  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.75 
 
 
220 aa  118  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.27 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  40 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  39.18 
 
 
201 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  30.93 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  38.46 
 
 
201 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  34.12 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  34.12 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  31.28 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  29.9 
 
 
208 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.88 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  31.05 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  31.05 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  30.41 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  32.26 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  30.57 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  31.05 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  29.8 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.17 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  31.4 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.53 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  33.68 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  29.56 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.5 
 
 
205 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  30.26 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.65 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.7 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.69 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  30.65 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  30.26 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.22 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  29.41 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  30.53 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  28.43 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  29.06 
 
 
231 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  30.96 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.98 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  29.56 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  29.32 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  30 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  27.84 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  26.26 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  32.29 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  29.41 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  26.2 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  30.81 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  29.17 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  29.19 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.76 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  30.05 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  29.41 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  31.75 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3983  glutathione S-transferase-like  32.78 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.409574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  30.58 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  29.8 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.22 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  31.84 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  28.51 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.26 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  27.86 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.72 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>