More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2883 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2883  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527212  normal  0.219041 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0016  glutathione S-transferase-like protein  59.46 
 
 		 224 aa  254  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0486825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0966  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.57 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  47.85 
 
 		 214 aa  185  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5781  Glutathione S-transferase domain protein  46.51 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0789  Glutathione S-transferase domain  46.67 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1077  Glutathione S-transferase domain protein  43.33 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0926  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.6 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.017472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.6 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0079  glutathione S-transferase-like  42.86 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3950  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.75 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1469  glutathione S-transferase-like  42.11 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368467  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4891  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.9 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3560  Glutathione S-transferase domain  41.26 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.945145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2824  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.23 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0033  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.5 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8292  Glutathione S-transferase domain protein  44.7 
 
 		 213 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.6 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562576  normal  0.573525 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5257  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.86 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3111  putative glutathione S-transferase  43.18 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.73 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00883028  normal  0.988624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1407  Glutathione S-transferase domain protein  41.4 
 
 		 212 aa  141  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0606838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2579  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.59 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.983145  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2245  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.67 
 
 		 207 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.23 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5865  glutathione S-transferase-like protein  40.46 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  30.65 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  33.12 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  29.38 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  31.94 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.11 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2427  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.18 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340237  normal  0.0428234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  29.38 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0769  glutathione S-transferase  34.18 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  29.29 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3732  Glutathione S-transferase domain protein  29.41 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  31.16 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  30.85 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1633  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0604815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  28.8 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  30.65 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.53 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  27.42 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1581  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.88 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242583  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  27 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1147  Glutathione S-transferase domain  26.88 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  26.32 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  27.81 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  29.95 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1600  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.88 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  0.388565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.74 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7359  putative glutathione S-transferase  28.21 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.35 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  32.87 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  32.84 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6162  Glutathione S-transferase domain  30.18 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87377  predicted protein  34.43 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.86791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  29.19 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  28.02 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  27.72 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3395  putative glutathione S-transferase  30.46 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  32.34 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.63 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1655  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.34 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440036  normal  0.557594 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  26.34 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1170  glutathione S-transferase  29.61 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40070  putative glutathione S-transferase  31.47 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  30.37 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.79 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  28.71 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  28.34 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  30.15 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.72 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.34 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.15 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.23 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  25.81 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  32.16 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  32.16 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.59 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  28.28 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  27.69 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.44 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  28.28 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  31.5 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  25.54 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.7 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.1 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.34 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.221401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>