More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2579 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2579  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.983145  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5257  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.72 
 
 
220 aa  272  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2245  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.02 
 
 
207 aa  260  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8292  Glutathione S-transferase domain protein  52.86 
 
 
213 aa  230  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1407  Glutathione S-transferase domain protein  53.52 
 
 
212 aa  222  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0606838  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0033  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.71 
 
 
216 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
212 aa  210  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562576  normal  0.573525 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.76 
 
 
210 aa  201  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0016  glutathione S-transferase-like protein  44.71 
 
 
224 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0486825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  41.9 
 
 
214 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3111  putative glutathione S-transferase  40.87 
 
 
232 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
232 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00883028  normal  0.988624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0926  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.64 
 
 
217 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.017472  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0789  Glutathione S-transferase domain  39.55 
 
 
216 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2883  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.67 
 
 
223 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527212  normal  0.219041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0079  glutathione S-transferase-like  38.53 
 
 
221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4891  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.33 
 
 
216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0966  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.38 
 
 
219 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3560  Glutathione S-transferase domain  39.9 
 
 
213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.945145  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1077  Glutathione S-transferase domain protein  36.82 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147439  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3950  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.98 
 
 
227 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532798  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5781  Glutathione S-transferase domain protein  38.16 
 
 
217 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2824  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.85 
 
 
216 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1469  glutathione S-transferase-like  35.32 
 
 
217 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.38 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  35 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  35 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  35 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  31.64 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  31.64 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  29.38 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  34.39 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1834  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.91 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.83 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  30.05 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  34.39 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.39 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.86 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  29.17 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  31.68 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  28.85 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  32.49 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  28.37 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.39 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.38 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.8 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  29.41 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.88 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.37 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  27.66 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  29.47 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  30.56 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5865  glutathione S-transferase-like protein  42.31 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  27.45 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2427  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340237  normal  0.0428234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  28.95 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  28.64 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.8 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  28.31 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.95 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  27.91 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.21 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.31 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  32.02 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  27.01 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.32 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.8 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.21 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  27.84 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  27.66 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  27.32 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.29 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1170  glutathione S-transferase  29.45 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859877  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.32 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  27.27 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  30.41 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  29.06 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.7 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  27.66 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  32.26 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.85 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.47 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  32.05 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  29.41 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  27.64 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.67 
 
 
227 aa  64.7  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0769  glutathione S-transferase  30.06 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608104  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.94 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.34 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  26.4 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  27.88 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  27.94 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>