More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2196 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
208 aa  430  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  60.1 
 
 
208 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  60.1 
 
 
208 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  59.13 
 
 
226 aa  260  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  59.13 
 
 
208 aa  257  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.65 
 
 
208 aa  255  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  50.23 
 
 
225 aa  228  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  49.77 
 
 
225 aa  226  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  53.2 
 
 
208 aa  225  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.55 
 
 
233 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  49.55 
 
 
233 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.55 
 
 
233 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  49.32 
 
 
221 aa  222  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  48.65 
 
 
222 aa  221  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.65 
 
 
222 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.3 
 
 
222 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.3 
 
 
222 aa  214  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  49.75 
 
 
208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  49.55 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  47.51 
 
 
223 aa  208  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  46.85 
 
 
222 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  49.1 
 
 
224 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.78 
 
 
206 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  49.55 
 
 
222 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.12 
 
 
220 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  47.75 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  46.73 
 
 
205 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.73 
 
 
222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.8 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.8 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.8 
 
 
208 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  47.32 
 
 
208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  49.08 
 
 
218 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  49.08 
 
 
218 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.17 
 
 
218 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  43.89 
 
 
220 aa  192  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  45.98 
 
 
221 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.41 
 
 
209 aa  189  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  44.55 
 
 
224 aa  187  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  43.38 
 
 
222 aa  185  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  41.59 
 
 
232 aa  180  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  44.67 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  45.18 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.54 
 
 
221 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.41 
 
 
221 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  43.24 
 
 
229 aa  174  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  43.17 
 
 
227 aa  173  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  41.04 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  46.12 
 
 
206 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.05 
 
 
232 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  41.51 
 
 
214 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.45 
 
 
221 aa  167  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  42.6 
 
 
232 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  41.71 
 
 
209 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  43.78 
 
 
209 aa  165  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  42.27 
 
 
222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  42.27 
 
 
222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  42.27 
 
 
222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  42.27 
 
 
222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  42.27 
 
 
222 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.1 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  38.83 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.16 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.47 
 
 
229 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  38.5 
 
 
201 aa  158  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  40.98 
 
 
213 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  44.44 
 
 
211 aa  155  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  37.26 
 
 
221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.39 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  33.64 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  33.64 
 
 
222 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  33.61 
 
 
255 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  41.36 
 
 
245 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.96 
 
 
121 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0348  glutathione S-transferase  43.8 
 
 
124 aa  104  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  33.17 
 
 
221 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.68 
 
 
202 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  29.52 
 
 
216 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  30.95 
 
 
216 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  31.36 
 
 
218 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  30.29 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  29.9 
 
 
225 aa  98.2  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.36 
 
 
202 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.58 
 
 
221 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  29.44 
 
 
225 aa  94.7  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  26.37 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.5 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  28.78 
 
 
219 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  29.95 
 
 
218 aa  88.6  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
217 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 
210 aa  84.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  29.81 
 
 
222 aa  84.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  29.35 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.08 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  26.47 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
205 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  28.92 
 
 
209 aa  82  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  28.36 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>