More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3640 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
217 aa  434  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1148  glutathione S-transferase-like  46.48 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  48.13 
 
 
222 aa  167  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.09 
 
 
213 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.42 
 
 
202 aa  127  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  40.47 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.14 
 
 
233 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  38.14 
 
 
233 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.14 
 
 
233 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.07 
 
 
222 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.6 
 
 
222 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  35.32 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  34.86 
 
 
225 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  37.67 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  36.19 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  36.36 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  35 
 
 
209 aa  108  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  34.72 
 
 
222 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  36.07 
 
 
224 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  36.24 
 
 
218 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.56 
 
 
220 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  31.98 
 
 
205 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 
206 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  34.52 
 
 
209 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.1 
 
 
208 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  36.27 
 
 
208 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  33.48 
 
 
222 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  36.41 
 
 
208 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 
218 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  31.8 
 
 
208 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.7 
 
 
229 aa  101  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  34.63 
 
 
226 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.62 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  35.29 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.34 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 
207 aa  99  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  34.1 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  30.81 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.15 
 
 
208 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  33.49 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  30.65 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.15 
 
 
208 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  28.64 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 
209 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  32.34 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  32.26 
 
 
220 aa  95.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  34.47 
 
 
208 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  36.1 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  34.13 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.16 
 
 
205 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  33.65 
 
 
210 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  31.22 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
210 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  31.31 
 
 
205 aa  92  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  32.44 
 
 
232 aa  91.7  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  36.63 
 
 
201 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  36.07 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.12 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.44 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  32.87 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.95 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  36.14 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  31.31 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  30.94 
 
 
227 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.83 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.98 
 
 
205 aa  88.6  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  36.14 
 
 
201 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  35.2 
 
 
214 aa  88.6  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  34.95 
 
 
198 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.93 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
208 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
208 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  26.27 
 
 
221 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.36 
 
 
222 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4777  glutathione S-transferase family protein  32.98 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
210 aa  84.7  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  31.82 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.68 
 
 
214 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.73 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  32.68 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0926  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.46 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.017472  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0408  glutathione S-transferase-like  34.2 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.53035  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  34.31 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0966  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.1 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  34.39 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  31.12 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  30.77 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  31.19 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  31.47 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  36.36 
 
 
236 aa  82  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>