More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3528 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  100 
 
 		 210 aa  437  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  32.23 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.96 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.34 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  30.3 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.99 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  33 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  30.96 
 
 		 202 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.96 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  32.7 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.65 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  34 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.41 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0408  glutathione S-transferase-like  33.92 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.53035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.02 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  27.86 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  31.82 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  32.02 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.32 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  30.39 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  30.39 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  30.39 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  30.77 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.06 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  29.56 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.56 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  28.93 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  31.31 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  31.41 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  27.55 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  30.81 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.46 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.55 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  31.05 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  30.81 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  31.25 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.46 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.01 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  31.05 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  27.94 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.63 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  31.16 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.94 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.01 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.92 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.09 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.42 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1174  Glutathione S-transferase domain protein  31.16 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.24 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.37 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.08 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.37 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  32.51 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  42.7 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2358  Glutathione S-transferase domain protein  31.21 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.426471  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  44.94 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  31.47 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.18 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  32.4 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  28.88 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  33.14 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2873  glutathione S-transferase-like  27.5 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.480428  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  30.96 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  30.53 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.81 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4837  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.29 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.05 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.37 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.77 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  28.77 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.77 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  29.1 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.77 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  25.89 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  25 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  41.57 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  30.72 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  28.77 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  39.08 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  42.5 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.87 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  28.79 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  42.5 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  27.54 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  29.65 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2769  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.8 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  32.16 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.77 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>