More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1174 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1174  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 
207 aa  427  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3104  Glutathione S-transferase domain protein  93.24 
 
 
207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2499  glutathione S-transferase  68.6 
 
 
207 aa  307  8e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2072  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.76 
 
 
207 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165134  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4777  glutathione S-transferase family protein  66.67 
 
 
207 aa  295  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2536  glutathione S-transferase family protein  67.15 
 
 
207 aa  291  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.869863  normal  0.0380869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.67 
 
 
207 aa  291  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.948185  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2021  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.67 
 
 
207 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2200  putative glutathione S-transferase-like protein  64.25 
 
 
225 aa  290  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801388  hitchhiker  0.00721495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2009  Glutathione S-transferase domain  63.77 
 
 
207 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500519  normal  0.375789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4821  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.84 
 
 
207 aa  273  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62479  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5413  glutathione S-transferase-like  61.84 
 
 
207 aa  273  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763921  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5448  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.84 
 
 
207 aa  273  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40070  putative glutathione S-transferase  63.29 
 
 
207 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151976  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0203  glutathione S-transferase-like protein  59.9 
 
 
207 aa  271  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4793  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.94 
 
 
207 aa  267  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5335  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.45 
 
 
207 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222761  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3395  putative glutathione S-transferase  61.35 
 
 
207 aa  264  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0016  glutathione S-transferase  57.97 
 
 
207 aa  258  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.02 
 
 
211 aa  257  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0807444 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0017  glutathione S-transferase family protein  55.56 
 
 
207 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0014  glutathione S-transferase  55.56 
 
 
207 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1164  glutathione S-transferase  55.56 
 
 
207 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1521  glutathione S-transferase  55.56 
 
 
207 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0019  glutathione S-transferase family protein  55.56 
 
 
207 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207851  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1443  glutathione S-transferase  55.56 
 
 
207 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0018  glutathione S-transferase  55.56 
 
 
207 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4710  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.45 
 
 
207 aa  248  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131353  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1177  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.14 
 
 
207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.902666  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1819  Glutathione S-transferase domain protein  50.73 
 
 
207 aa  228  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.820795  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4025  Glutathione S-transferase domain  47.34 
 
 
201 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.853688  normal  0.245138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  43.81 
 
 
207 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3227  Glutathione S-transferase domain  43.3 
 
 
207 aa  175  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.805689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3002  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.78 
 
 
207 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.404999  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0239  glutathione S-transferase-like protein  42.93 
 
 
209 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.361263  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4438  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.5 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4241  glutathione S-transferase-like  41.33 
 
 
206 aa  161  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2741  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.42 
 
 
203 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  40.5 
 
 
208 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2747  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.38 
 
 
206 aa  154  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2665  putative glutathione S-transferase  38.38 
 
 
206 aa  154  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1542  putative glutathione S-transferase  38.38 
 
 
206 aa  154  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1887  Glutathione S-transferase domain protein  39.15 
 
 
206 aa  151  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0742  Glutathione S-transferase domain protein  41.18 
 
 
213 aa  151  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1508  glutathione S-transferase domain-containing protein  38 
 
 
211 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0984  gst-related protein  41.58 
 
 
213 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149147  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27755  glutathione S-transferase  38.38 
 
 
206 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3352  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148422  hitchhiker  0.0000403309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4895  Glutathione S-transferase domain  38.5 
 
 
208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.123273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  37 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3856  glutathione S-transferase family protein  37 
 
 
207 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1629  glutathione S-transferase  38 
 
 
207 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.197221  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4182  glutathione S-transferase-like protein  37 
 
 
227 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.645028  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2300  Glutathione S-transferase domain protein  35.35 
 
 
205 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0914  Glutathione S-transferase domain protein  39.6 
 
 
213 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0845  Glutathione S-transferase domain  39.6 
 
 
213 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00564189  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3730  glutathione S-transferase-like  36.92 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1946  Glutathione S-transferase domain protein  35.86 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.243361  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2238  glutathione S-transferase domain-containing protein  35 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1623  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.85 
 
 
206 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.012281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3602  Glutathione S-transferase domain  32.83 
 
 
206 aa  137  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383025  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0376  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.78 
 
 
213 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.411138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2784  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.5 
 
 
220 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0350061  hitchhiker  0.000562262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2514  glutathione S-transferase-like protein  37.17 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225019  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1487  glutathione S-transferase  37.69 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  39 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1679  Glutathione S-transferase domain protein  34.85 
 
 
205 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000555439  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  38.19 
 
 
214 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.19 
 
 
214 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1504  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 
207 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0951  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.16 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.69 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1894  glutathione S-transferase family protein  34.16 
 
 
207 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3821  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.16 
 
 
207 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2053  putative glutathione S-transferase  41.14 
 
 
213 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70347  normal  0.153383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2351  glutathione S-transferase  34.98 
 
 
214 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2684  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.93 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1469  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 
207 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7686  glutathione S-transferase-like protein  36.18 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474064  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1987  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.9 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1148  Glutathione S-transferase protein  33.5 
 
 
213 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2400  Glutathione S-transferase domain protein  30.81 
 
 
205 aa  121  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1994  glutathione S-transferase-like  37.37 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1609  glutathione S-transferase-like protein  37.13 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3556  Glutathione S-transferase domain protein  35.68 
 
 
215 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2218  Glutathione S-transferase domain  37.85 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1699  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1014  glutathione S-transferase family protein  32.5 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0683472  normal  0.818596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0898  glutathione S-transferase family protein  32 
 
 
208 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0995  glutathione S-transferase family protein  32 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.80831  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0934  glutathione S-transferase family protein  32 
 
 
208 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0966  glutathione S-transferase family protein  31.5 
 
 
208 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3580  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 
198 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0483717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00805  predicted glutathione S-transferase  31.98 
 
 
208 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2804  Glutathione S-transferase domain protein  31.98 
 
 
208 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0864  glutathione S-transferase family protein  31.98 
 
 
208 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0990  glutathione S-transferase family protein  31.98 
 
 
208 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.472621 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0908  glutathione S-transferase family protein  31.98 
 
 
208 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00822  hypothetical protein  31.98 
 
 
208 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2804  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.98 
 
 
208 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>