More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4777 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4777  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 
207 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.91 
 
 
207 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.948185  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2536  glutathione S-transferase family protein  73.43 
 
 
207 aa  327  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.869863  normal  0.0380869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2021  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.91 
 
 
207 aa  327  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2499  glutathione S-transferase  71.5 
 
 
207 aa  315  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2072  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.24 
 
 
207 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165134  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3104  Glutathione S-transferase domain protein  67.63 
 
 
207 aa  297  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1174  Glutathione S-transferase domain protein  66.67 
 
 
207 aa  295  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40070  putative glutathione S-transferase  67.63 
 
 
207 aa  294  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151976  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2009  Glutathione S-transferase domain  65.7 
 
 
207 aa  293  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500519  normal  0.375789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3395  putative glutathione S-transferase  66.18 
 
 
207 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2200  putative glutathione S-transferase-like protein  64.25 
 
 
225 aa  286  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801388  hitchhiker  0.00721495 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0016  glutathione S-transferase  61.84 
 
 
207 aa  284  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4793  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.77 
 
 
207 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5335  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.77 
 
 
207 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222761  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0203  glutathione S-transferase-like protein  63.29 
 
 
207 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0014  glutathione S-transferase  61.35 
 
 
207 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1521  glutathione S-transferase  61.35 
 
 
207 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1164  glutathione S-transferase  61.35 
 
 
207 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0017  glutathione S-transferase family protein  61.35 
 
 
207 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0018  glutathione S-transferase  61.35 
 
 
207 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0019  glutathione S-transferase family protein  61.35 
 
 
207 aa  279  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207851  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1443  glutathione S-transferase  61.35 
 
 
207 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4821  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.32 
 
 
207 aa  277  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62479  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5413  glutathione S-transferase-like  62.32 
 
 
207 aa  277  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763921  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5448  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.32 
 
 
207 aa  277  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.77 
 
 
211 aa  261  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0807444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4710  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.45 
 
 
207 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131353  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1819  Glutathione S-transferase domain protein  50.73 
 
 
207 aa  221  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.820795  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1177  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.52 
 
 
207 aa  222  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.902666  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4025  Glutathione S-transferase domain  48.31 
 
 
201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.853688  normal  0.245138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0239  glutathione S-transferase-like protein  45 
 
 
209 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.361263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4182  glutathione S-transferase-like protein  42.5 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.645028  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4241  glutathione S-transferase-like  43.59 
 
 
206 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1629  glutathione S-transferase  41 
 
 
207 aa  158  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.197221  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  42.56 
 
 
207 aa  158  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3227  Glutathione S-transferase domain  42.35 
 
 
207 aa  158  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.805689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4438  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.12 
 
 
206 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0742  Glutathione S-transferase domain protein  42.72 
 
 
213 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  40.7 
 
 
206 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3002  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.05 
 
 
207 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.404999  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2741  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.64 
 
 
203 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3730  glutathione S-transferase-like  40.59 
 
 
205 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27755  glutathione S-transferase  40.2 
 
 
206 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1508  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.79 
 
 
211 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3602  Glutathione S-transferase domain  38.19 
 
 
206 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383025  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0984  gst-related protein  44.06 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149147  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3856  glutathione S-transferase family protein  39 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2665  putative glutathione S-transferase  36.82 
 
 
206 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2747  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 
206 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1542  putative glutathione S-transferase  36.82 
 
 
206 aa  151  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2784  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.09 
 
 
220 aa  148  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0350061  hitchhiker  0.000562262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0845  Glutathione S-transferase domain  41.26 
 
 
213 aa  148  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00564189  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0914  Glutathione S-transferase domain protein  41.26 
 
 
213 aa  148  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4895  Glutathione S-transferase domain  40.39 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.123273 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2300  Glutathione S-transferase domain protein  37.19 
 
 
205 aa  145  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1623  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.012281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  38.42 
 
 
208 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1894  glutathione S-transferase family protein  39 
 
 
207 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3352  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 
208 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148422  hitchhiker  0.0000403309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3821  glutathione S-transferase domain-containing protein  39 
 
 
207 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1946  Glutathione S-transferase domain protein  35.32 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.243361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1504  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.5 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0951  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.68 
 
 
206 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1679  Glutathione S-transferase domain protein  35.82 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000555439  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2514  glutathione S-transferase-like protein  36.59 
 
 
214 aa  138  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225019  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1887  Glutathione S-transferase domain protein  38.1 
 
 
206 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2351  glutathione S-transferase  38.05 
 
 
214 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0376  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.8 
 
 
213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.411138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1469  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2053  putative glutathione S-transferase  37.02 
 
 
213 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70347  normal  0.153383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1148  Glutathione S-transferase protein  35.96 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2684  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.86 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  38.12 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2238  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1487  glutathione S-transferase  35 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2400  Glutathione S-transferase domain protein  36.14 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2218  Glutathione S-transferase domain  36.54 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1994  glutathione S-transferase-like  38.5 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418655  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 
214 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7686  glutathione S-transferase-like protein  35.15 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474064  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1609  glutathione S-transferase-like protein  37.38 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3556  Glutathione S-transferase domain protein  36.14 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  35 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  35 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1987  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.83 
 
 
220 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3580  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.25 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0483717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0898  glutathione S-transferase family protein  33.83 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0995  glutathione S-transferase family protein  33.83 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.80831  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0966  glutathione S-transferase family protein  33.83 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1014  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0683472  normal  0.818596 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0934  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00805  predicted glutathione S-transferase  35.32 
 
 
208 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0864  glutathione S-transferase family protein  35.32 
 
 
208 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2804  Glutathione S-transferase domain protein  35.32 
 
 
208 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0899  glutathione S-transferase family protein  35.32 
 
 
208 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.717795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0908  glutathione S-transferase family protein  35.32 
 
 
208 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0990  glutathione S-transferase family protein  35.32 
 
 
208 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.472621 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00822  hypothetical protein  35.32 
 
 
208 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2804  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.32 
 
 
208 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>