More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2873 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2873  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
256 aa  531  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.480428  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2865  glutathione S-transferase-like  35.83 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0706359  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2091  glutathione S-transferase-like  34.47 
 
 
257 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00729429  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  27.07 
 
 
270 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2872  glutathione S-transferase-like  25.52 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  27.04 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.7 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  29.84 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  27.62 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  26.69 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.63 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  27.2 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7338  glutathione S-transferase-like protein  28.44 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475649  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  27.12 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.93 
 
 
234 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  28.88 
 
 
229 aa  79  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  27.39 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4938  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.15 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1948  hypothetical protein  25.22 
 
 
207 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  28.27 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  29.26 
 
 
222 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.1 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1953  hypothetical protein  24.78 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3493  glutathione S-transferase  28.51 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0558771  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  26.4 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1147  Glutathione S-transferase domain  27.27 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1581  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.93 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  27.08 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  27.69 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3732  Glutathione S-transferase domain protein  27.02 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3350  putative glutathione S-transferase  27.42 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.1 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  38.54 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  28.42 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0090  glutathione S-transferase  24.89 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162685  normal  0.0936415 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1655  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.8 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440036  normal  0.557594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  28.1 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6162  Glutathione S-transferase domain  28.42 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1600  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.51 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  0.388565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3071  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.91 
 
 
269 aa  72  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.46 
 
 
240 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.21 
 
 
227 aa  72  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  40.22 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.33 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0551186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.38 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  26.45 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  27.5 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.83 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4793  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.84 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5335  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.84 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222761  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  25.43 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  26.07 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  26.45 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  27 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0512  glutathione S-transferase-like protein  26.56 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.624431  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  36.36 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  26.09 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  27.62 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0203  glutathione S-transferase-like protein  27.59 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  29.2 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.25 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.58 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  39.13 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  27.31 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  28.21 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  26.29 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5448  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.14 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5413  glutathione S-transferase-like  28.14 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763921  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4821  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.14 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62479  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.56 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00249355  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  28.27 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.72 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  25.97 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  25.62 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.45 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.44 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.85 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  28.25 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.25 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.2 
 
 
206 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  35.48 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4617  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.23 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  26.86 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  26.97 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.74 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.97 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3984  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.83 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1522  Glutathione S-transferase domain protein  23.5 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.34 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  36.96 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  25.74 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.39 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  26.42 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3602  Glutathione S-transferase domain  24.67 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383025  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  33.98 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  25.4 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2831  maleylacetoacetate isomerase  37.89 
 
 
213 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.21 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>