More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5247 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  100 
 
 
219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7338  glutathione S-transferase-like protein  36.87 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475649  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  33.82 
 
 
360 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2340  glutathione S-transferase  31.98 
 
 
272 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0809017  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  32.13 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  29.78 
 
 
219 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.84 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6849  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.87 
 
 
112 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  29.33 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  31.8 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  30.09 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  29.95 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  32.78 
 
 
213 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  33.53 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.53 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51860  Glutathione S-transferase, N-terminal:Glutathione S-transferase, C-terminal  30 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3332  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4182  glutathione S-transferase-like protein  32.18 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.645028  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  29.38 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.04 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  27.23 
 
 
241 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  29.21 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.56 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.92 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  30.88 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.73 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  31.9 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  34.09 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7686  glutathione S-transferase-like protein  32.95 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474064  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27755  glutathione S-transferase  30.62 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2483  glutathione S-transferase-like protein  28.5 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.478501  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.79 
 
 
214 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  32.79 
 
 
214 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  27.18 
 
 
217 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  29.76 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.74 
 
 
225 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  30.69 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  27.03 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  27.45 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.4 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.24 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  31.98 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3002  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.404999  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  28.71 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.5 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.22 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  29 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  33 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  32.76 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  30.81 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  33.17 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2873  glutathione S-transferase-like  26.29 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.480428  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.69 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.72 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.72 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  31.88 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.69 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1508  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  25.85 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  30.39 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  30.81 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1629  glutathione S-transferase  29.13 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.197221  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.04 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3821  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.69 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  31.15 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  28.57 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1469  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.69 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  26.77 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  25.62 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1894  glutathione S-transferase family protein  31.69 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.9 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  31.68 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.07 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210533  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  29.81 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  27.14 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.69 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3227  Glutathione S-transferase domain  32.5 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.805689 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  32.6 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  26.47 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  29.71 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  31.71 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  31.88 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2440  glutathione S-transferase-like  28.57 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0170  putative glutathione S-transferase  26.92 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>