More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6309 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
267 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  34.69 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.81 
 
 
225 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  30.54 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.24 
 
 
225 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  28.39 
 
 
221 aa  85.9  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  29.24 
 
 
241 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2865  glutathione S-transferase-like  28.22 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0706359  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2872  glutathione S-transferase-like  29.92 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2873  glutathione S-transferase-like  26.7 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.480428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  27.97 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
232 aa  79  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.88 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  28.45 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  27.2 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.31 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2091  glutathione S-transferase-like  24.68 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00729429  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.54 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  31.36 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  30.24 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  28.63 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  25.96 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  29.66 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3071  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.49 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  29.76 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  29.76 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  29.76 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  27.66 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  33.71 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  29.66 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.43 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  26.45 
 
 
223 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  31.84 
 
 
214 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  29.5 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1905  glutathione S-transferase family protein  26.44 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2048  maleylacetoacetate isomerase  38.1 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424671  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  29.24 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  32.14 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  31.52 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  27.27 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.71 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  27.27 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2272  maleylacetoacetate isomerase  37.14 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0111358  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  30.15 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2422  glutathione S-transferase-like protein  33.62 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.64 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  30.15 
 
 
210 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  27.35 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.49 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.8 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.36 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1560  glutathione S-transferase-like  26.46 
 
 
210 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25247  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  26.81 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  28.51 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.96 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  35.09 
 
 
217 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  24.68 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  38.64 
 
 
219 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  32.02 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  30.65 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.18 
 
 
203 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  26.18 
 
 
203 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.18 
 
 
203 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  26.18 
 
 
203 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.18 
 
 
203 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.18 
 
 
203 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.18 
 
 
203 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  27.35 
 
 
203 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  27.35 
 
 
203 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  27.35 
 
 
203 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  27.35 
 
 
203 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  27.35 
 
 
203 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  27.35 
 
 
203 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  27.35 
 
 
203 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  27.35 
 
 
203 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  28.92 
 
 
213 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  37.5 
 
 
219 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  28.33 
 
 
220 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.77 
 
 
208 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  41.67 
 
 
216 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.66 
 
 
214 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  29.07 
 
 
198 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  24.36 
 
 
221 aa  62.4  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0754  stringent starvation protein A  37.25 
 
 
212 aa  62.4  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00653635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  28.57 
 
 
214 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4219  maleylacetoacetate isomerase  30.39 
 
 
213 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.553079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4147  maleylacetoacetate isomerase  30.39 
 
 
213 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202832  normal  0.0442189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.75 
 
 
226 aa  62  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  26.41 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  26.41 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  40.62 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.79 
 
 
205 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  26.41 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  26.58 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  40.62 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  30 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  26.5 
 
 
203 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  25.86 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>