More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2695 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
208 aa  430  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  97.6 
 
 
208 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  91.35 
 
 
208 aa  401  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  90.87 
 
 
208 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  84.62 
 
 
208 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  84.62 
 
 
208 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  83.65 
 
 
208 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  83.65 
 
 
208 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.5 
 
 
210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.64 
 
 
211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  62.38 
 
 
203 aa  275  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  63.35 
 
 
209 aa  269  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  59.41 
 
 
204 aa  261  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  57.84 
 
 
204 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  43 
 
 
202 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.07 
 
 
205 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  45.27 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.8 
 
 
219 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  40.38 
 
 
210 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  39.42 
 
 
215 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  40.1 
 
 
209 aa  147  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  40.22 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  36.97 
 
 
215 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.81 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  39 
 
 
216 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  36.06 
 
 
209 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.86 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  37.25 
 
 
203 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  38.24 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.57 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.3 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.81 
 
 
205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  36.76 
 
 
206 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 
206 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  36.27 
 
 
203 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.21 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.54 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  36.23 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.33 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.47 
 
 
230 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.47 
 
 
230 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.68 
 
 
205 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.78 
 
 
231 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  30.54 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  29.25 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.66 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.59 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  29.59 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.59 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  27.05 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  29.81 
 
 
200 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  28.78 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  32.98 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  27.05 
 
 
201 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  31.07 
 
 
226 aa  81.3  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  30.15 
 
 
222 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  29.29 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  28.02 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  30.1 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  28.3 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  29.47 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  29.35 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  27.96 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  30.57 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  29 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.78 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.48 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  28.85 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  29.25 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  28.77 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.19 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  25.6 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  29.35 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  29.47 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  28.92 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  32.92 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  32.92 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.44 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  28.64 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  28.29 
 
 
233 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  27.8 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  27.54 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  30.21 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.67 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  30.05 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  27.5 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  27.45 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  28.16 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3430  putative glutathione S-transferase  27.78 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000029866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  27.32 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  27.67 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>