More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1577 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  91.83 
 
 		 208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  90.87 
 
 		 208 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  90.38 
 
 		 208 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  86.06 
 
 		 208 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  86.06 
 
 		 208 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  84.62 
 
 		 208 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  85.1 
 
 		 208 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.9 
 
 		 210 aa  295  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.29 
 
 		 211 aa  286  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  62.83 
 
 		 209 aa  269  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  61.39 
 
 		 203 aa  269  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  56.93 
 
 		 204 aa  254  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  55.39 
 
 		 204 aa  247  9e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.56 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  42.5 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  45.77 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.3 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  39.9 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  39.61 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  39.67 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  38.39 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.78 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  39 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  36.49 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  39.22 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  37.75 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  35.1 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.86 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  37.75 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.1 
 
 		 210 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.8 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.15 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  38.24 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.23 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  36.71 
 
 		 206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.89 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.98 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.98 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.3 
 
 		 231 aa  99.4  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.68 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  30.54 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.29 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  30.81 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  27.75 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  26.64 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  30.35 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.96 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  27.88 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  32.34 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  28.77 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  29.81 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  29.81 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  28.78 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  32.61 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.98 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  29.27 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  30.5 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  27.88 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  29.35 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  29.27 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  26.79 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  31.19 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  28.85 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  27.75 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  26.4 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  30 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  32.92 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  32.92 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  29.19 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  29.11 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  32.69 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  27.75 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  29.77 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  31.55 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  29.7 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  31.31 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  29.74 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  29.56 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  30.81 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.27 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.5 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  31.12 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  28.85 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.5 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  30.69 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>