More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1437 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  413  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.5 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  42.86 
 
 		 203 aa  167  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  37.44 
 
 		 202 aa  134  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  36.84 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  41.46 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.75 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  36.82 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  36.82 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.82 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  36.9 
 
 		 186 aa  121  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.54 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.82 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  34.13 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.32 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  37.07 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  36.95 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  36.59 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  36.59 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.47 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  34.93 
 
 		 216 aa  111  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.48 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.33 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.63 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  36.79 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  31.25 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.95 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.21 
 
 		 214 aa  97.8  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  35.15 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  30.95 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  35.26 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  36.61 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  33.16 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  28.08 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.95 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.41 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.41 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  35.52 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  28.86 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  35.75 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  34.97 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.62 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  35.96 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  34.72 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2048  maleylacetoacetate isomerase  34.12 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  37.71 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  27.59 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  35.96 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  38.22 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.04 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  35.91 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  36.78 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  31.46 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0409  Glutathione S-transferase domain protein  36.42 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  33.68 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  34.32 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  34.64 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  36.63 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  32.37 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.99 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.46 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  31.68 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  47.96 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  31.88 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2483  glutathione S-transferase-like protein  29.67 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.478501  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  36.22 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  29.56 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  34.38 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  36.22 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  36.5 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  32.14 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  35.14 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  27.94 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  29.33 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  36.22 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  31.84 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4182  glutathione S-transferase-like protein  31.48 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.645028  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  36.22 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  32.52 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  31.19 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  35.68 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  35.35 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  32.04 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2865  glutathione S-transferase-like  29.2 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0706359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  31.55 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  29.7 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  32.84 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2712  glutathione S-transferase-like  32.31 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  33.15 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>