More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0409 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0409  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.16 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  34.63 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0831  glutathione S-transferase family protein  34.3 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.42 
 
 		 202 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  33.01 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  29.91 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.67 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  29.91 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.98 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  32.85 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2757  hypothetical protein  34.09 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  34.09 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2483  glutathione S-transferase-like protein  28.65 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.478501  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.8 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  27.75 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  25.52 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  25.52 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.02 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0526  stringent starvation protein A  30.86 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0518789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0294  stringent starvation protein A  30.86 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0133166  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0462  stringent starvation protein A  30.86 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511157  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1132  stringent starvation protein A  30.86 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000177989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  27.55 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.62 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  26 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  26.83 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  30.41 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  25.59 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0301  stringent starvation protein A  31.14 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00830466  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2048  maleylacetoacetate isomerase  29.82 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  26 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  26.86 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  26 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  26.86 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  26.86 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  26.86 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  26.86 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  28.25 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  31.6 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  26.86 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  30.95 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  28.82 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  26.86 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  30.95 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3698  stringent starvation protein A  30.51 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  30.93 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.52 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  26.83 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  32.14 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.54 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.92 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  31.44 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  31.55 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  30.9 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  33.01 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  30.86 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.91 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  32.93 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  29.08 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  30.93 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  25.71 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.93 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  29.38 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  30.22 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  34.1 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  31.33 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  29.52 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  29.76 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  23.65 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.85 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  32.76 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  29.3 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4347  stringent starvation protein A  29.14 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000258123  hitchhiker  0.00803988 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  29.3 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  29.3 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.15 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  29.3 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  29.25 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3483  maleylacetoacetate isomerase  31.43 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2205  glutathione S-transferase-like protein  31.93 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.213168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.14 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  31.93 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  26.44 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  25.94 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  27.23 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  28.07 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  35.12 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.39 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4437  stringent starvation protein A  27.75 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  27.11 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.93 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  30.46 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  29.82 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>