More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3331 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 
212 aa  427  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  64.76 
 
 
212 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  61.72 
 
 
212 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1191  maleylacetoacetate isomerase  69.05 
 
 
211 aa  261  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.916605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  64.76 
 
 
210 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  64.76 
 
 
210 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  62.26 
 
 
212 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  62.2 
 
 
211 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  64.59 
 
 
210 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  63.81 
 
 
210 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  61.43 
 
 
212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  55.87 
 
 
213 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  57.21 
 
 
216 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  57.67 
 
 
216 aa  238  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  56.28 
 
 
216 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  56.28 
 
 
216 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  55.35 
 
 
216 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  55.35 
 
 
216 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  55.35 
 
 
216 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  54.88 
 
 
216 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  52.63 
 
 
215 aa  230  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  54.42 
 
 
216 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  54.72 
 
 
222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  50.92 
 
 
220 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  46.98 
 
 
216 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  51.16 
 
 
216 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  47.91 
 
 
215 aa  214  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  52.11 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  53.02 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  51.4 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  53.02 
 
 
220 aa  211  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  48.6 
 
 
214 aa  209  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  50.23 
 
 
221 aa  209  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 
216 aa  207  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  48.37 
 
 
214 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 
214 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 
214 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 
214 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 
214 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  49.77 
 
 
212 aa  203  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 
213 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  55.4 
 
 
217 aa  202  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  48.84 
 
 
214 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 
214 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 
214 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 
214 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  50.7 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  48.37 
 
 
229 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  47.91 
 
 
214 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  48.84 
 
 
214 aa  198  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  46.01 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  48.84 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  48.37 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  47.2 
 
 
215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  45.58 
 
 
217 aa  194  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  48.74 
 
 
214 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  44.71 
 
 
212 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  47.44 
 
 
212 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  49.25 
 
 
214 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  49.25 
 
 
214 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  46.43 
 
 
222 aa  191  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  49.25 
 
 
214 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 
214 aa  191  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  46.51 
 
 
213 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  43.27 
 
 
212 aa  188  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  46.98 
 
 
214 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  45.29 
 
 
222 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  44.65 
 
 
212 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  51.17 
 
 
210 aa  184  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  45.58 
 
 
214 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  47.89 
 
 
216 aa  184  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  44.86 
 
 
216 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  44.65 
 
 
215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  43.95 
 
 
221 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 
216 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  44.65 
 
 
213 aa  181  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  45.83 
 
 
212 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  46.23 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  41.01 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  47.76 
 
 
200 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  41.7 
 
 
222 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  45.75 
 
 
214 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  47.92 
 
 
210 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  41.26 
 
 
222 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  45.75 
 
 
214 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  45.05 
 
 
210 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  44.13 
 
 
215 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  45.75 
 
 
214 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  45.75 
 
 
214 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  48.34 
 
 
214 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  48.34 
 
 
219 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 
217 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  45.59 
 
 
216 aa  174  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  45.07 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  41.12 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  44.81 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1019  maleylacetoacetate isomerase  49.29 
 
 
218 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 
213 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  41.86 
 
 
216 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>