More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0301 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0301  stringent starvation protein A  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00830466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0294  stringent starvation protein A  99.53 
 
 		 213 aa  434  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0133166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  93.9 
 
 		 213 aa  411  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  93.43 
 
 		 213 aa  411  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0462  stringent starvation protein A  88.26 
 
 		 213 aa  390  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4347  stringent starvation protein A  87.79 
 
 		 213 aa  390  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000258123  hitchhiker  0.00803988 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1132  stringent starvation protein A  88.26 
 
 		 213 aa  390  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000177989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0526  stringent starvation protein A  88.73 
 
 		 213 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0518789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  86.12 
 
 		 212 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  86.12 
 
 		 212 aa  370  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  86.12 
 
 		 212 aa  370  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  86.12 
 
 		 212 aa  370  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  86.12 
 
 		 212 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  86.12 
 
 		 212 aa  370  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  86.12 
 
 		 212 aa  370  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  86.12 
 
 		 212 aa  370  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  86.12 
 
 		 212 aa  370  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  85.65 
 
 		 212 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  85.65 
 
 		 212 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  85.65 
 
 		 212 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  85.65 
 
 		 212 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  85.65 
 
 		 212 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  83.25 
 
 		 212 aa  357  6e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00886  stringent starvation protein A  77.03 
 
 		 211 aa  340  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004506  stringent starvation protein A  76.56 
 
 		 211 aa  338  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000234692  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4437  stringent starvation protein A  74.64 
 
 		 213 aa  331  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  75.6 
 
 		 211 aa  329  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0573  stringent starvation protein A  72.73 
 
 		 209 aa  323  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.206079  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2659  stringent starvation protein A  71.49 
 
 		 221 aa  322  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3273  stringent starvation protein A  72.73 
 
 		 209 aa  322  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.42421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3703  stringent starvation protein A  72.73 
 
 		 209 aa  321  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3760  stringent starvation protein A  72.73 
 
 		 209 aa  321  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000134387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3886  stringent starvation protein A  72.73 
 
 		 209 aa  321  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0604  stringent starvation protein A  73.21 
 
 		 209 aa  321  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.202043  hitchhiker  0.000247718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0565  stringent starvation protein A  72.73 
 
 		 209 aa  321  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000178546  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0605  stringent starvation protein A  72.73 
 
 		 209 aa  320  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000737921  normal  0.076273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3425  stringent starvation protein A  72.73 
 
 		 209 aa  320  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0632774  normal  0.103062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0611  stringent starvation protein A  73.21 
 
 		 209 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3018  stringent starvation protein A  71.77 
 
 		 209 aa  318  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00907689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0804  stringent starvation protein A  71.77 
 
 		 209 aa  315  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000607549  hitchhiker  0.0080229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3304  stringent starvation protein A  71.29 
 
 		 209 aa  316  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  71.29 
 
 		 209 aa  316  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3198  stringent starvation protein A  70.81 
 
 		 209 aa  315  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  72.95 
 
 		 210 aa  314  7e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4163  stringent starvation protein A  71.29 
 
 		 209 aa  314  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3698  stringent starvation protein A  71.5 
 
 		 210 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.269325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2871  stringent starvation protein A  67.46 
 
 		 211 aa  305  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0754  stringent starvation protein A  65.52 
 
 		 212 aa  286  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00653635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2205  glutathione S-transferase-like protein  61.54 
 
 		 208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.213168  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  59.91 
 
 		 217 aa  267  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2467  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.78 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  56.73 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2757  hypothetical protein  60.58 
 
 		 206 aa  257  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  60.58 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  58.42 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.5 
 
 		 205 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2398  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.1 
 
 		 210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211782  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.5 
 
 		 207 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1320  stringent starvation protein A  60 
 
 		 207 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4529  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.5 
 
 		 207 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3160  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase C subunit  58.17 
 
 		 211 aa  238  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.571951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  60 
 
 		 207 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  59.5 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  55.5 
 
 		 205 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  59 
 
 		 205 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  59 
 
 		 205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2216  Glutathione S-transferase domain protein  54.07 
 
 		 208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  55.5 
 
 		 205 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  54.33 
 
 		 208 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1522  Glutathione S-transferase domain protein  53.66 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2208  glutathione S-transferase  51.71 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  51.9 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1739  glutathione S-transferase-like protein  50.24 
 
 		 213 aa  208  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1364  Glutathione S-transferase domain  48.56 
 
 		 211 aa  207  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1877  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.12 
 
 		 211 aa  205  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.59174  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1942  stringent starvation protein A  47.12 
 
 		 211 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13090  Stringent starvation protein A  56 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00438  stringent starvation protein A  48.48 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240997  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  44.71 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  44.71 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  47.24 
 
 		 199 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.73 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0706663  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  46.23 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  44.72 
 
 		 199 aa  184  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  45.73 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  46.8 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.8 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.8 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  45.81 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  45.32 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  45.32 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  45.32 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  45.32 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.32 
 
 		 203 aa  175  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  42.21 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.81 
 
 		 203 aa  174  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  45.81 
 
 		 203 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  45.81 
 
 		 203 aa  174  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  45.81 
 
 		 203 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.81 
 
 		 203 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>