More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3160 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3160  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase C subunit  100 
 
 		 211 aa  435  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.571951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2467  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.87 
 
 		 209 aa  291  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2205  glutathione S-transferase-like protein  64.73 
 
 		 208 aa  288  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.213168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2398  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.45 
 
 		 210 aa  283  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211782  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.11 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  62.2 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  60.89 
 
 		 205 aa  257  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  60.77 
 
 		 205 aa  254  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  60.77 
 
 		 205 aa  254  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1320  stringent starvation protein A  58.37 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4529  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.81 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  59.41 
 
 		 205 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.37 
 
 		 207 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3304  stringent starvation protein A  61.08 
 
 		 209 aa  251  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3273  stringent starvation protein A  59.41 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.42421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3198  stringent starvation protein A  59.9 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0294  stringent starvation protein A  58.74 
 
 		 213 aa  248  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0133166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0604  stringent starvation protein A  58.91 
 
 		 209 aa  248  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.202043  hitchhiker  0.000247718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0301  stringent starvation protein A  58.74 
 
 		 213 aa  247  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00830466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3760  stringent starvation protein A  59.41 
 
 		 209 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000134387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0565  stringent starvation protein A  59.41 
 
 		 209 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000178546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3886  stringent starvation protein A  59.41 
 
 		 209 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3703  stringent starvation protein A  59.41 
 
 		 209 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  58.25 
 
 		 213 aa  247  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.37 
 
 		 207 aa  247  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0611  stringent starvation protein A  58.91 
 
 		 209 aa  246  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0462  stringent starvation protein A  57.69 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  57.92 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0573  stringent starvation protein A  57.92 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.206079  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0605  stringent starvation protein A  58.42 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000737921  normal  0.076273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3425  stringent starvation protein A  58.42 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0632774  normal  0.103062 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0526  stringent starvation protein A  57.77 
 
 		 213 aa  244  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0518789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  58.85 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  58.85 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  58.85 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  58.85 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  58.85 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  58.85 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  58.85 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  58.85 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  58.85 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  57.28 
 
 		 213 aa  244  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  59.81 
 
 		 212 aa  244  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1132  stringent starvation protein A  57.28 
 
 		 213 aa  242  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000177989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  58.45 
 
 		 212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  58.45 
 
 		 212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  58.45 
 
 		 212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3018  stringent starvation protein A  57.92 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00907689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  58.45 
 
 		 212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  58.45 
 
 		 212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0804  stringent starvation protein A  57.92 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000607549  hitchhiker  0.0080229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4347  stringent starvation protein A  57.28 
 
 		 213 aa  241  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000258123  hitchhiker  0.00803988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4163  stringent starvation protein A  56.44 
 
 		 209 aa  241  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3698  stringent starvation protein A  55.56 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.269325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4437  stringent starvation protein A  55.24 
 
 		 213 aa  238  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2757  hypothetical protein  54.85 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  54.85 
 
 		 206 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  54.95 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004506  stringent starvation protein A  56.04 
 
 		 211 aa  234  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000234692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00886  stringent starvation protein A  55.56 
 
 		 211 aa  234  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  55.02 
 
 		 211 aa  231  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2659  stringent starvation protein A  53.46 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13090  Stringent starvation protein A  55.83 
 
 		 205 aa  228  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  51.94 
 
 		 217 aa  221  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2871  stringent starvation protein A  51.23 
 
 		 211 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0754  stringent starvation protein A  53.27 
 
 		 212 aa  217  7.999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00653635  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  51.44 
 
 		 220 aa  214  9e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2208  glutathione S-transferase  50.72 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  51.98 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  52.88 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2216  Glutathione S-transferase domain protein  50.24 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1522  Glutathione S-transferase domain protein  49.03 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  49.03 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1739  glutathione S-transferase-like protein  45.63 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1364  Glutathione S-transferase domain  49.02 
 
 		 211 aa  191  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00438  stringent starvation protein A  48.48 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240997  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1942  stringent starvation protein A  46.57 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1877  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.08 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.59174  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  42.42 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  42.93 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  40.61 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  40.59 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  40.59 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  41.12 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1423  stringent starvation protein A  45.45 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0302836  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  41.67 
 
 		 204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.38 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  39.8 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.02 
 
 		 199 aa  160  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0706663  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1586  glutathione S-transferase-like  45.45 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.09 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  40.1 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.59 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  39.11 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  40.59 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.59 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  39.11 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  38.61 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.1 
 
 		 203 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  40.1 
 
 		 203 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>