More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1423 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1423  stringent starvation protein A  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0302836  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1586  glutathione S-transferase-like  93.63 
 
 
204 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0793  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.52 
 
 
204 aa  282  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3160  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase C subunit  45.45 
 
 
211 aa  157  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.571951  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  45.18 
 
 
205 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3198  stringent starvation protein A  42.86 
 
 
209 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  45.18 
 
 
205 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0605  stringent starvation protein A  41.87 
 
 
209 aa  154  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000737921  normal  0.076273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3425  stringent starvation protein A  41.87 
 
 
209 aa  154  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0632774  normal  0.103062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3304  stringent starvation protein A  43.35 
 
 
209 aa  154  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3273  stringent starvation protein A  41.38 
 
 
209 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.42421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3018  stringent starvation protein A  43.39 
 
 
209 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00907689  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2398  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.33 
 
 
210 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211782  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0604  stringent starvation protein A  41.38 
 
 
209 aa  153  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.202043  hitchhiker  0.000247718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0565  stringent starvation protein A  41.38 
 
 
209 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000178546  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3760  stringent starvation protein A  41.38 
 
 
209 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000134387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0611  stringent starvation protein A  41.38 
 
 
209 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3886  stringent starvation protein A  41.38 
 
 
209 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3703  stringent starvation protein A  41.38 
 
 
209 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172344  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.45 
 
 
205 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3698  stringent starvation protein A  42.13 
 
 
210 aa  151  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.269325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4437  stringent starvation protein A  41.87 
 
 
213 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4163  stringent starvation protein A  43.15 
 
 
209 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527161  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  44.44 
 
 
205 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4347  stringent starvation protein A  42.08 
 
 
213 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000258123  hitchhiker  0.00803988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  44.44 
 
 
205 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0804  stringent starvation protein A  43.15 
 
 
209 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000607549  hitchhiker  0.0080229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0573  stringent starvation protein A  41.87 
 
 
209 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.206079  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  44.44 
 
 
205 aa  148  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  43.72 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4529  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.67 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  42.13 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  40.98 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  40.98 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  40.98 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  40.98 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0526  stringent starvation protein A  42.08 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0518789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  40.98 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0462  stringent starvation protein A  42.08 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.16 
 
 
207 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  41.53 
 
 
213 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1132  stringent starvation protein A  42.08 
 
 
213 aa  144  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000177989  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  41.12 
 
 
210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  39.89 
 
 
212 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  39.89 
 
 
212 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1320  stringent starvation protein A  43.65 
 
 
207 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264365  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  39.89 
 
 
212 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  39.89 
 
 
212 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0294  stringent starvation protein A  41.85 
 
 
213 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0133166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  39.89 
 
 
212 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  39.89 
 
 
212 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  39.89 
 
 
212 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  39.89 
 
 
212 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2205  glutathione S-transferase-like protein  38.27 
 
 
208 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.213168  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  39.89 
 
 
212 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  41.53 
 
 
213 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0301  stringent starvation protein A  41.85 
 
 
213 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00830466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2467  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.78 
 
 
209 aa  141  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00886  stringent starvation protein A  39.41 
 
 
211 aa  141  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  38.8 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004506  stringent starvation protein A  38.92 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000234692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.88 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  39.9 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2659  stringent starvation protein A  40 
 
 
221 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  41.27 
 
 
206 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2757  hypothetical protein  41.27 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  39.34 
 
 
220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  39.34 
 
 
209 aa  134  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  39.89 
 
 
208 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2871  stringent starvation protein A  37.44 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0987194  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0754  stringent starvation protein A  38.25 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00653635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1739  glutathione S-transferase-like protein  37.07 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13090  Stringent starvation protein A  44.16 
 
 
205 aa  130  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2216  Glutathione S-transferase domain protein  39.11 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2208  glutathione S-transferase  39.09 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1078  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1522  Glutathione S-transferase domain protein  37.5 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  36.82 
 
 
206 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  36.82 
 
 
206 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  37.57 
 
 
198 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1942  stringent starvation protein A  35.52 
 
 
211 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00438  stringent starvation protein A  34.9 
 
 
201 aa  121  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240997  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1877  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.97 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.59174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1364  Glutathione S-transferase domain  33.85 
 
 
211 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  37.16 
 
 
214 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  35.2 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  36.61 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
203 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 
203 aa  115  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  34.41 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.24 
 
 
203 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.79 
 
 
203 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.59 
 
 
204 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.08 
 
 
203 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  34.08 
 
 
203 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.08 
 
 
203 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.08 
 
 
203 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>