More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3198 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3198  stringent starvation protein A  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3304  stringent starvation protein A  94.74 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0565  stringent starvation protein A  90.91 
 
 		 209 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000178546  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3760  stringent starvation protein A  90.91 
 
 		 209 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000134387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0611  stringent starvation protein A  90.91 
 
 		 209 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3703  stringent starvation protein A  90.91 
 
 		 209 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3886  stringent starvation protein A  90.91 
 
 		 209 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0604  stringent starvation protein A  90.91 
 
 		 209 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.202043  hitchhiker  0.000247718 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3273  stringent starvation protein A  92.34 
 
 		 209 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.42421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0605  stringent starvation protein A  90.43 
 
 		 209 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000737921  normal  0.076273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3425  stringent starvation protein A  90.43 
 
 		 209 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0632774  normal  0.103062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3018  stringent starvation protein A  86.6 
 
 		 209 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00907689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0573  stringent starvation protein A  84.21 
 
 		 209 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.206079  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  85.17 
 
 		 209 aa  377  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4163  stringent starvation protein A  85.1 
 
 		 209 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0804  stringent starvation protein A  83.25 
 
 		 209 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000607549  hitchhiker  0.0080229 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  74.88 
 
 		 210 aa  318  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  71.29 
 
 		 213 aa  315  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0294  stringent starvation protein A  70.81 
 
 		 213 aa  315  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0133166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0301  stringent starvation protein A  70.81 
 
 		 213 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00830466  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  70.81 
 
 		 213 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0526  stringent starvation protein A  69.38 
 
 		 213 aa  311  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0518789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0462  stringent starvation protein A  68.9 
 
 		 213 aa  309  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511157  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1132  stringent starvation protein A  68.9 
 
 		 213 aa  309  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000177989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4347  stringent starvation protein A  67.94 
 
 		 213 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000258123  hitchhiker  0.00803988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4437  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 213 aa  303  8.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004506  stringent starvation protein A  69.86 
 
 		 211 aa  301  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000234692  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 212 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  67.62 
 
 		 212 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 212 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 212 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 212 aa  301  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 212 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  67.62 
 
 		 212 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 212 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 212 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00886  stringent starvation protein A  69.86 
 
 		 211 aa  301  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 212 aa  300  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 212 aa  300  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 212 aa  300  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 212 aa  300  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  67.62 
 
 		 212 aa  300  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  68.57 
 
 		 211 aa  298  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3698  stringent starvation protein A  68.6 
 
 		 210 aa  295  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.269325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2871  stringent starvation protein A  66.67 
 
 		 211 aa  293  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  65.24 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2659  stringent starvation protein A  64.38 
 
 		 221 aa  288  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2205  glutathione S-transferase-like protein  61.54 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.213168  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  62.02 
 
 		 206 aa  268  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2757  hypothetical protein  61.54 
 
 		 206 aa  267  8e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2467  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.27 
 
 		 209 aa  263  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  59.42 
 
 		 217 aa  255  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  58.17 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  59.9 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0754  stringent starvation protein A  59.9 
 
 		 212 aa  252  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00653635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2398  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.62 
 
 		 210 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211782  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3160  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase C subunit  58.82 
 
 		 211 aa  238  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.571951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2216  Glutathione S-transferase domain protein  54.07 
 
 		 208 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.5 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4529  glutathione S-transferase domain-containing protein  58 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  58 
 
 		 205 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1320  stringent starvation protein A  57.5 
 
 		 207 aa  230  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  57.5 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.5 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  56 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  56.73 
 
 		 208 aa  228  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  58 
 
 		 207 aa  227  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  57 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  55.5 
 
 		 205 aa  225  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2208  glutathione S-transferase  52.2 
 
 		 207 aa  222  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1522  Glutathione S-transferase domain protein  51.96 
 
 		 209 aa  218  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  49.04 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1364  Glutathione S-transferase domain  49.52 
 
 		 211 aa  204  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1739  glutathione S-transferase-like protein  46.83 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  46.38 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  46.38 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13090  Stringent starvation protein A  53.5 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1877  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.6 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.59174  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00438  stringent starvation protein A  50 
 
 		 201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240997  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1942  stringent starvation protein A  47.12 
 
 		 211 aa  197  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.73 
 
 		 199 aa  191  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0706663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  43.94 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  42.71 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  42.21 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  40.91 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.65 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  42.16 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  41.87 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  40.2 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  41.38 
 
 		 203 aa  158  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  41.87 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  41.38 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  41.87 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  41.38 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.38 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1423  stringent starvation protein A  42.86 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0302836  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  41.38 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  41.38 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  41.38 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  41.38 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>