More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4529 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4529  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  95.65 
 
 		 207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1320  stringent starvation protein A  95.17 
 
 		 207 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  92.27 
 
 		 207 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  82.93 
 
 		 205 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  82.44 
 
 		 205 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  82.44 
 
 		 205 aa  350  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.46 
 
 		 205 aa  345  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  79.51 
 
 		 205 aa  334  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  78.54 
 
 		 205 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13090  Stringent starvation protein A  69.31 
 
 		 205 aa  272  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2467  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.81 
 
 		 209 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2398  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.19 
 
 		 210 aa  256  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211782  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2205  glutathione S-transferase-like protein  60 
 
 		 208 aa  255  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.213168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3160  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase C subunit  58.85 
 
 		 211 aa  248  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.571951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  59 
 
 		 213 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  58.5 
 
 		 213 aa  241  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0294  stringent starvation protein A  59.5 
 
 		 213 aa  239  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0133166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0301  stringent starvation protein A  59.5 
 
 		 213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00830466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0804  stringent starvation protein A  58.71 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000607549  hitchhiker  0.0080229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3273  stringent starvation protein A  60 
 
 		 209 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.42421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3886  stringent starvation protein A  60 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3703  stringent starvation protein A  60 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0573  stringent starvation protein A  57.71 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.206079  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0565  stringent starvation protein A  60 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000178546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00886  stringent starvation protein A  58.5 
 
 		 211 aa  236  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3760  stringent starvation protein A  60 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000134387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  58.71 
 
 		 209 aa  236  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4163  stringent starvation protein A  58.21 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004506  stringent starvation protein A  58 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000234692  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3304  stringent starvation protein A  59.2 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0605  stringent starvation protein A  59.5 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000737921  normal  0.076273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3425  stringent starvation protein A  59.5 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0632774  normal  0.103062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0604  stringent starvation protein A  59 
 
 		 209 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.202043  hitchhiker  0.000247718 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  58 
 
 		 211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3018  stringent starvation protein A  59.7 
 
 		 209 aa  234  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00907689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4437  stringent starvation protein A  57 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0611  stringent starvation protein A  59 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3198  stringent starvation protein A  58 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2659  stringent starvation protein A  55.29 
 
 		 221 aa  231  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0462  stringent starvation protein A  56.28 
 
 		 213 aa  227  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0526  stringent starvation protein A  56.28 
 
 		 213 aa  227  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0518789  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3698  stringent starvation protein A  54.81 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.269325  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  55.72 
 
 		 210 aa  226  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1132  stringent starvation protein A  55.78 
 
 		 213 aa  225  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000177989  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  56 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  56 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  56 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  56 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  56 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  56 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  56 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  56 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  56 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  55.5 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  55.5 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  55.5 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  55.5 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  55.5 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4347  stringent starvation protein A  54.5 
 
 		 213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000258123  hitchhiker  0.00803988 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  50.75 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  54.5 
 
 		 212 aa  214  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2757  hypothetical protein  50.75 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2871  stringent starvation protein A  51 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  54.04 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  51.47 
 
 		 214 aa  206  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2208  glutathione S-transferase  50.48 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  49.5 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  49.5 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.74 
 
 		 199 aa  193  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0706663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  50.73 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0754  stringent starvation protein A  47.69 
 
 		 212 aa  191  8e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00653635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2216  Glutathione S-transferase domain protein  49.73 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1522  Glutathione S-transferase domain protein  46.89 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1739  glutathione S-transferase-like protein  45.05 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  44.72 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  44.72 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  43.5 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  44.78 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1364  Glutathione S-transferase domain  46.08 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00438  stringent starvation protein A  46.04 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240997  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1942  stringent starvation protein A  44.28 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1877  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.78 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.59174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  39.5 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  40.8 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  39.3 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  39.6 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  39.6 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  39.6 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  39.6 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  39.6 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  39.6 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  39.6 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  39.6 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  39.11 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.6 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  39.6 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.6 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  39.6 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.6 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>