More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3824 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  51.15 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.64 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  48.18 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.27 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.73 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.81 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  43.93 
 
 		 218 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  46.34 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  44.19 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  45.37 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  43.72 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  44.88 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.31 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  42.03 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  42.31 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.31 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.31 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.31 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3183  putative glutathione S-transferase  39.81 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0938037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  41.83 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  44.88 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.29 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1372  Glutathione S-transferase domain  39.81 
 
 		 215 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00129076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  40.58 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.29 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  40.93 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  40.47 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  40.47 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  41 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.72 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.62 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  32.87 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  34.12 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  31.21 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  32.91 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.42 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.64 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  28.57 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  31.71 
 
 		 186 aa  72  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  29.11 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  26.64 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  25.64 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  25.64 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  33.52 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  29.3 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.56 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  29.34 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  28.22 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.09 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.29 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.7 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0706663  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  32.39 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  27.18 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1522  Glutathione S-transferase domain protein  28.19 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0804  stringent starvation protein A  30.57 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000607549  hitchhiker  0.0080229 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  30.57 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  30.57 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  30.57 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  30.57 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  30.57 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  28.57 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3542  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.39 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  30.57 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  30.57 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  30.57 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  31.65 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1320  stringent starvation protein A  28.75 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.11 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.11 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  30.57 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  29.94 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  37.37 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  30.57 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  30.57 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  29.94 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.57 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  30.57 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  30.57 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.66 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  30.57 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  26.64 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.64 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  34.69 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.42 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.45 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.86 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.11 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  28.93 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5254  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.18 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>