More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2264 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  97.71 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  86.7 
 
 		 218 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  88.53 
 
 		 218 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  88.07 
 
 		 218 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  88.07 
 
 		 218 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  87.61 
 
 		 218 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.77 
 
 		 224 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.77 
 
 		 218 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.77 
 
 		 218 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  69.77 
 
 		 218 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.77 
 
 		 218 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  69.77 
 
 		 218 aa  314  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.05 
 
 		 218 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.57 
 
 		 210 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3183  putative glutathione S-transferase  58.22 
 
 		 215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0938037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1372  Glutathione S-transferase domain  59.15 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00129076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.13 
 
 		 215 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  53.02 
 
 		 213 aa  211  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  51.66 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.17 
 
 		 214 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  51.39 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.58 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  47.69 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  47.22 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.63 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  43.72 
 
 		 224 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.57 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  40.09 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.15 
 
 		 220 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.57 
 
 		 220 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  37.74 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.81 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  33.64 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  31.71 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  29.82 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  27.11 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  29.82 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0203  glutathione S-transferase-like protein  28.57 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  26.73 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.76 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.69 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4793  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.12 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5335  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.12 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.65 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2072  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.16 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5448  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.79 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  32.14 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4821  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.79 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62479  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5413  glutathione S-transferase-like  28.79 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763921  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.23 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.53 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  26.55 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  29.76 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  30.25 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  29.76 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  28.99 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  29.76 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.03 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  29.95 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  29.76 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5254  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.71 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.03 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0809  Glutathione S-transferase domain protein  30.91 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  27.52 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  29.17 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  24.77 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  29.94 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  29.17 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  28.99 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  28.65 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.86 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3580  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.14 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0483717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  23.93 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  27.22 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  27.71 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.35 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  28.39 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  25.97 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  30.14 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  26.35 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.68 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.37 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.88 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  25.47 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  27.95 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57200  putative glutathione S-transferase  28.68 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.25 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  30.11 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.68 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  25.68 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1739  glutathione S-transferase-like protein  26.25 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.68 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  29.17 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3395  putative glutathione S-transferase  30.23 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  30.16 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  24.39 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>