More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0205 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  96.82 
 
 
220 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  94.09 
 
 
220 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  90.91 
 
 
220 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  61.19 
 
 
219 aa  278  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  47.73 
 
 
224 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.24 
 
 
214 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  45.97 
 
 
213 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.37 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  42.51 
 
 
213 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  40.45 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  41.83 
 
 
217 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.27 
 
 
220 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  38.07 
 
 
225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  41.35 
 
 
217 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.91 
 
 
215 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.62 
 
 
218 aa  148  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1372  Glutathione S-transferase domain  39.34 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00129076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3183  putative glutathione S-transferase  38.39 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0938037  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  41.04 
 
 
218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  40.57 
 
 
218 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  39.62 
 
 
218 aa  138  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  38.68 
 
 
218 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  38.68 
 
 
218 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  38.68 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.89 
 
 
218 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  37.74 
 
 
218 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.12 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.12 
 
 
218 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  38.12 
 
 
218 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.12 
 
 
218 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.12 
 
 
218 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  38.12 
 
 
218 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.42 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  30.43 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  35.37 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  32.32 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.61 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  30.73 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  30.43 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  26.43 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  32.89 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.7 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  28.18 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  27.43 
 
 
221 aa  62.4  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  30.77 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  27.96 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.03 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  26.57 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2873  glutathione S-transferase-like  27.5 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.480428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.58 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  29.55 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  25.76 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.27 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  30.68 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  29.22 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4147  maleylacetoacetate isomerase  27.32 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202832  normal  0.0442189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  27.17 
 
 
203 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4219  maleylacetoacetate isomerase  27.32 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.553079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  27.4 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  30.11 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  33.96 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  28.9 
 
 
216 aa  58.5  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  30.43 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.38 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.56 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.1 
 
 
202 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.09 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.41 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  23.66 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  31.06 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3542  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.64 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  25.68 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2831  maleylacetoacetate isomerase  25.52 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  34.21 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  33.64 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4440  maleylacetoacetate isomerase  28.29 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.716277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.48 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  26.83 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  30.72 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.32 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  30.72 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0069  Glutathione S-transferase domain protein  29.63 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  26.83 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7338  glutathione S-transferase-like protein  28.09 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475649  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3920  putative glutathione S-transferase  36.56 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  29.45 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  31.33 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  29.19 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.78 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  27.01 
 
 
391 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  28.14 
 
 
198 aa  55.5  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  33.68 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0180074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>