More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0208 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  95 
 
 		 220 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  94.09 
 
 		 220 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  89.55 
 
 		 220 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  62.1 
 
 		 219 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  48.64 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.85 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  46.92 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.83 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  44.17 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.51 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  43.41 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  42.79 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.73 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  42.31 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  38.07 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.91 
 
 		 215 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  41.04 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1372  Glutathione S-transferase domain  39.34 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00129076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3183  putative glutathione S-transferase  38.39 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0938037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  40.57 
 
 		 218 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  40.57 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  40.57 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  40.09 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  39.15 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  39.62 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.84 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.79 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  36.79 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.79 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.79 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.79 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  36.79 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  31.6 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.6 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  35.98 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  32.32 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.52 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  31.11 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  31.13 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.13 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.48 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  28.64 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  29.86 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.91 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  28 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.72 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  24.89 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  34.36 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  30.41 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  24.77 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.84 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3542  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.15 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709402  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  23.79 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  33.74 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  26.54 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  30.1 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  28.88 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0177  glutathione S-transferase family protein  27.36 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0356  Glutathione S-transferase domain  27.36 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  29.52 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7338  glutathione S-transferase-like protein  29.21 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  27.89 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  34.91 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2048  maleylacetoacetate isomerase  30.21 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.48 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.79 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.54 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  26.42 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.39 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  34.58 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  31.68 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.63 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  37.63 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.62 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.11 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.56 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  29.05 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5335  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.75 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.73 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.53 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  28.04 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  27.27 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4793  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.23 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.97456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.36 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  26.83 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.06 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  29.56 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2348  glutathione S-transferase-like protein  32.08 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  27.75 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  29.07 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0203  glutathione S-transferase-like protein  29.73 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  35.11 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  31.13 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  28.97 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.05 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>