More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0108 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
204 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  48.73 
 
 
204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.22 
 
 
204 aa  179  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  46.53 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.22 
 
 
205 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.77 
 
 
206 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0787  Glutathione S-transferase domain  47.29 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  46.31 
 
 
206 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4837  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.46 
 
 
206 aa  168  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  39.13 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0613  putative glutathione S-transferase  36.02 
 
 
233 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.68 
 
 
215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173214  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.61 
 
 
214 aa  117  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  35.61 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  35.61 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.54 
 
 
214 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  30.29 
 
 
203 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.63 
 
 
217 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
205 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  34.5 
 
 
205 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  31.66 
 
 
201 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  32.5 
 
 
203 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  34.48 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  33.17 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  31.73 
 
 
202 aa  97.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  33.99 
 
 
201 aa  97.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  30.39 
 
 
196 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  31.16 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.15 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4120  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  30.77 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 
202 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  29.67 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  36.59 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  31.4 
 
 
204 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  29.47 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.38 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  29.65 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.02 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  30.95 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.37 
 
 
202 aa  89  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  29.9 
 
 
202 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  31.38 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  27.88 
 
 
202 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  30.65 
 
 
204 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  30.85 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  32.02 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  28.14 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  27.4 
 
 
204 aa  85.1  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  27.4 
 
 
204 aa  85.1  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  30.81 
 
 
201 aa  84.7  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.33 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  30.85 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2442  glutathione S-transferase-like protein  29.27 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666537  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  29.06 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  29.06 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  29.06 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  29.79 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  29.33 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6303  glutathione S-transferase-like protein  31.38 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.06 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  31.4 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  29.35 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  29.76 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2946  glutathione S-transferase-like  29.56 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.0000427807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  29.81 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3309  glutathione S-transferase protein  31.9 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  28.64 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2860  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.61 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2997  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.61 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0895357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2771  glutathione S-transferase-like protein  28.5 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260265  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2337  glutathione S-transferase-like  31.09 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0459494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.4 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2951  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.09 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.1 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  31.58 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3341  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  28.86 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2945  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.42 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1002  glutathione S-transferase, putative  30.05 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0944  putative glutathione S-transferase  30.05 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  31.58 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  31.68 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2972  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.09 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6524  maleylacetoacetate isomerase  28.21 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  28.64 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  36.29 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.27 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.29 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  31.44 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4263  glutathione S-transferase-like protein  29.67 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  26.26 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2005  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0271018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1845  glutathionine S-transferase  28.5 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000002496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2347  glutathionine S-transferase  28.5 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1994  glutathionine S-transferase  28.5 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  0.0251972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>