More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5409 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  91.59 
 
 
214 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  91.59 
 
 
214 aa  400  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.89 
 
 
214 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.99 
 
 
215 aa  291  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173214  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  66.83 
 
 
215 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0613  putative glutathione S-transferase  52.11 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.57 
 
 
206 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  44.44 
 
 
204 aa  154  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4837  glutathione S-transferase domain-containing protein  43 
 
 
206 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  39.9 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.96 
 
 
204 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.51 
 
 
217 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  42.36 
 
 
206 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0787  Glutathione S-transferase domain  42.86 
 
 
206 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4120  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.63 
 
 
214 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.21 
 
 
205 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2860  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.44 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6303  glutathione S-transferase-like protein  43.43 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2997  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.94 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0895357  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2946  glutathione S-transferase-like  37.8 
 
 
207 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.0000427807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  36.53 
 
 
217 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2337  glutathione S-transferase-like  43.43 
 
 
212 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0459494  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2951  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.43 
 
 
212 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2945  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.43 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2972  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.93 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1303  glutathione S-transferase  39.32 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.14 
 
 
206 aa  121  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  37.2 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  35.32 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  35.61 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  36.49 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  40.09 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  37.96 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2404  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.15 
 
 
214 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0926545  normal  0.705614 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  38.39 
 
 
203 aa  112  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0332  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.81 
 
 
205 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.14 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  36.19 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  36.19 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  33.64 
 
 
220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1115  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5431  Glutathione S-transferase domain protein  37.32 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4683  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.96 
 
 
214 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  27.49 
 
 
216 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48720  Glutathione S-transferase  37.02 
 
 
209 aa  108  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0872  glutathione S-transferase-like  31.78 
 
 
225 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  34.13 
 
 
201 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  34.62 
 
 
204 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  37.32 
 
 
201 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  34.62 
 
 
204 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  36.06 
 
 
205 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1740  Glutathione S-transferase domain protein  32.04 
 
 
204 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  34.13 
 
 
204 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  32.21 
 
 
201 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2166  putative glutathione S-transferase  35.44 
 
 
213 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  35.21 
 
 
201 aa  101  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  36.54 
 
 
201 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0129  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 
219 aa  101  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  33.97 
 
 
206 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.85 
 
 
201 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.06 
 
 
203 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  36.06 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1474  glutathione S-transferase, putative  33.01 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  36.06 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  36.06 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1190  Glutathione S-transferase domain  33.01 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  32.06 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  36.06 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.36 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  32.69 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  32.69 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  32.69 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1076  glutathione S-transferase  32.71 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.079186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.02 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  33.65 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01605  glutathionine S-transferase  35.58 
 
 
201 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2005  Glutathione S-transferase domain protein  35.58 
 
 
201 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0271018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1994  glutathionine S-transferase  35.58 
 
 
201 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  0.0251972 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1845  glutathionine S-transferase  35.58 
 
 
201 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000002496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1825  glutathionine S-transferase  35.58 
 
 
201 aa  95.5  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.603364  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01595  hypothetical protein  35.58 
 
 
201 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1711  glutathionine S-transferase  35.58 
 
 
201 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2347  glutathionine S-transferase  35.58 
 
 
201 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0484  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.3 
 
 
205 aa  95.1  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02544  glutathione S-transferase GST-4.5  31.88 
 
 
204 aa  94.7  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  35.24 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  35.35 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  31.13 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1850  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  36.23 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  33.17 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3309  glutathione S-transferase protein  36.32 
 
 
202 aa  92.4  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 
216 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  31.13 
 
 
201 aa  92  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  36.54 
 
 
204 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  32.06 
 
 
204 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  34.43 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  28.91 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>