More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0042 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.23 
 
 		 202 aa  329  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.74 
 
 		 202 aa  322  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  75.25 
 
 		 202 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.77 
 
 		 216 aa  311  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  72.77 
 
 		 202 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.83 
 
 		 202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  59.41 
 
 		 204 aa  247  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  57.43 
 
 		 204 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  56.44 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  59.5 
 
 		 201 aa  238  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  58.91 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  55.45 
 
 		 204 aa  235  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  55.45 
 
 		 204 aa  235  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  55.72 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  55.45 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  53.47 
 
 		 204 aa  227  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  53.5 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.73 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  54.5 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.5 
 
 		 202 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.47 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.48 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.76 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3341  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  53.2 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  51.24 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4118  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.05 
 
 		 210 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579715 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4769  glutathione S-transferase-like  49.05 
 
 		 218 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3398  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.05 
 
 		 210 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.24 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  46.5 
 
 		 201 aa  205  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2771  glutathione S-transferase-like protein  47.57 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  50.74 
 
 		 203 aa  201  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  49 
 
 		 204 aa  201  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  44.5 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3504  Glutathione S-transferase domain  49.01 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3179  Glutathione S-transferase domain protein  48.51 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  50.74 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.26 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3309  glutathione S-transferase protein  46.8 
 
 		 202 aa  187  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2442  glutathione S-transferase-like protein  47.98 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666537  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  47.52 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  46 
 
 		 201 aa  184  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01595  hypothetical protein  45 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01605  glutathionine S-transferase  45 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2005  Glutathione S-transferase domain protein  45 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0271018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1994  glutathionine S-transferase  45 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  0.0251972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2347  glutathionine S-transferase  45 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1711  glutathionine S-transferase  45 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1845  glutathionine S-transferase  45 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000002496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1825  glutathionine S-transferase  45 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.603364  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  50.75 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  46 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  46 
 
 		 201 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  46 
 
 		 201 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  46 
 
 		 201 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  46 
 
 		 201 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  43 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  43 
 
 		 202 aa  178  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  45 
 
 		 204 aa  177  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  42.27 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0838  Glutathione S-transferase domain  46.57 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  43 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0958  Glutathione S-transferase domain protein  46.57 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3328  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.68 
 
 		 211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.934349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  41.29 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  41.29 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  44.55 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1298  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.79 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.323445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4046  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.3 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.862482  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1002  glutathione S-transferase, putative  41.09 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0944  putative glutathione S-transferase  41.09 
 
 		 201 aa  151  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6902  putative glutathione S-transferase  41.79 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.232185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.2 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4263  glutathione S-transferase-like protein  40.3 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02544  glutathione S-transferase GST-4.5  35.75 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  41.06 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2900  putative glutathionine S-transferase  44.24 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0484  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.36 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  39.8 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  38.35 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  34.91 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  37.56 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0787  Glutathione S-transferase domain  36.63 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2419  putative glutathione S-transferase  44.76 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2779  putative glutathione S-transferase  44.76 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0597  glutathione S-transferase, putative  44.76 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1730  putative glutathione S-transferase  44.76 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175509  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2872  putative glutathione S-transferase  44.76 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2840  glutathione S-transferase  44.76 
 
 		 220 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5431  Glutathione S-transferase domain protein  35.12 
 
 		 299 aa  114  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.8 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  32.18 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.23 
 
 		 205 aa  111  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2721  putative glutathione S-transferase  43.36 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  35.12 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>