More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3179 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3179  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 
209 aa  423  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3504  Glutathione S-transferase domain  93.78 
 
 
209 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3309  glutathione S-transferase protein  72.77 
 
 
202 aa  301  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  59.02 
 
 
206 aa  248  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  58.21 
 
 
203 aa  229  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  48.51 
 
 
202 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  50 
 
 
202 aa  194  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  48.28 
 
 
203 aa  191  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.03 
 
 
202 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.02 
 
 
202 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  45.77 
 
 
206 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  45 
 
 
201 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.02 
 
 
203 aa  181  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  46.5 
 
 
201 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  46.5 
 
 
201 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.53 
 
 
202 aa  179  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  46.04 
 
 
203 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  46.5 
 
 
201 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  48.5 
 
 
201 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  46.53 
 
 
202 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  44.06 
 
 
204 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  46.31 
 
 
204 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  45.54 
 
 
204 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  42 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  44.55 
 
 
204 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.78 
 
 
201 aa  170  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  43.07 
 
 
204 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  43.07 
 
 
204 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.45 
 
 
210 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  42.36 
 
 
204 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.22 
 
 
205 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.07 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2442  glutathione S-transferase-like protein  43.27 
 
 
204 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666537  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  44 
 
 
201 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  43.5 
 
 
204 aa  164  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  43.28 
 
 
201 aa  164  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  44 
 
 
202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  42 
 
 
201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01605  glutathionine S-transferase  42.5 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2005  Glutathione S-transferase domain protein  42.5 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0271018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1845  glutathionine S-transferase  42.5 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000002496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1825  glutathionine S-transferase  42.5 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.603364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2347  glutathionine S-transferase  42.5 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1711  glutathionine S-transferase  42.5 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01595  hypothetical protein  42.5 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1994  glutathionine S-transferase  42.5 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  0.0251972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  43.5 
 
 
201 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  43.5 
 
 
201 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  43.5 
 
 
201 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  43.5 
 
 
201 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  43.88 
 
 
202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  43 
 
 
202 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  40.5 
 
 
201 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  42.71 
 
 
196 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  41 
 
 
202 aa  154  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.83 
 
 
211 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3341  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.35 
 
 
210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  41.5 
 
 
204 aa  151  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  39.8 
 
 
201 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.79 
 
 
201 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0838  Glutathione S-transferase domain  41.43 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2419  putative glutathione S-transferase  52.82 
 
 
147 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2779  putative glutathione S-transferase  52.82 
 
 
147 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0597  glutathione S-transferase, putative  52.82 
 
 
220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  38.81 
 
 
201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2840  glutathione S-transferase  52.82 
 
 
220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2872  putative glutathione S-transferase  52.82 
 
 
221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1730  putative glutathione S-transferase  52.82 
 
 
221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175509  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0958  Glutathione S-transferase domain protein  42.38 
 
 
227 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  42.29 
 
 
205 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2771  glutathione S-transferase-like protein  39.81 
 
 
212 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260265  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1002  glutathione S-transferase, putative  42.08 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0944  putative glutathione S-transferase  42.08 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4118  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.1 
 
 
210 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579715 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4769  glutathione S-transferase-like  38.1 
 
 
218 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1298  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.8 
 
 
201 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.323445  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3398  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.1 
 
 
210 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  41.29 
 
 
206 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  39.41 
 
 
203 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2721  putative glutathione S-transferase  50.7 
 
 
147 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3328  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.95 
 
 
211 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.934349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6902  putative glutathione S-transferase  41.58 
 
 
214 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.232185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4046  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.5 
 
 
207 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.862482  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  40.29 
 
 
198 aa  131  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.23 
 
 
227 aa  131  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4263  glutathione S-transferase-like protein  38.19 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02544  glutathione S-transferase GST-4.5  36.71 
 
 
204 aa  115  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1850  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.81 
 
 
209 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185574 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0484  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.45 
 
 
205 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  36.23 
 
 
203 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  33.33 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  33.33 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0332  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5431  Glutathione S-transferase domain protein  29.9 
 
 
299 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  32.37 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  31.28 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.41 
 
 
206 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1740  Glutathione S-transferase domain protein  28.85 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1303  glutathione S-transferase  32.37 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.2 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>