More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0571 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
206 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  70.3 
 
 
206 aa  299  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0787  Glutathione S-transferase domain  66.83 
 
 
206 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  63.37 
 
 
205 aa  278  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4837  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.55 
 
 
206 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  62.38 
 
 
204 aa  258  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.38 
 
 
204 aa  257  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.2 
 
 
205 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  47.55 
 
 
215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  46.77 
 
 
204 aa  175  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.1 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173214  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0613  putative glutathione S-transferase  41.83 
 
 
233 aa  157  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  42.57 
 
 
214 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.57 
 
 
214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  41.58 
 
 
214 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.81 
 
 
217 aa  141  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.73 
 
 
214 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  36.76 
 
 
203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  35.29 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  34.31 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  34.31 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2337  glutathione S-transferase-like  39.15 
 
 
212 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0459494  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2951  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.15 
 
 
212 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451804  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.25 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2972  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.15 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6303  glutathione S-transferase-like protein  37.57 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2860  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.15 
 
 
212 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  37.07 
 
 
203 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2997  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.62 
 
 
212 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0895357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  34.16 
 
 
204 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2166  putative glutathione S-transferase  37.75 
 
 
213 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1303  glutathione S-transferase  38.73 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4120  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.81 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2945  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.01 
 
 
212 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  34.16 
 
 
204 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  33.66 
 
 
202 aa  117  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  34.85 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.78 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.31 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.13 
 
 
206 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.31 
 
 
202 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.44 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  31.68 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  35.29 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  32.84 
 
 
201 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  32.84 
 
 
201 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  32.84 
 
 
201 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  35.47 
 
 
204 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  32.84 
 
 
201 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2946  glutathione S-transferase-like  35.5 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.0000427807 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
205 aa  111  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  34.12 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  32.68 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48720  Glutathione S-transferase  38.73 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  34.8 
 
 
206 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  37.56 
 
 
198 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4683  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.56 
 
 
214 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  32.35 
 
 
204 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  31.86 
 
 
217 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  31.53 
 
 
204 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1115  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
214 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.39 
 
 
202 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  32.2 
 
 
201 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  31.37 
 
 
201 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  30.39 
 
 
202 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  31.37 
 
 
201 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2442  glutathione S-transferase-like protein  31.37 
 
 
204 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666537  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 
202 aa  101  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2404  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0926545  normal  0.705614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  34.07 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0129  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.1 
 
 
219 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  33 
 
 
196 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  30.24 
 
 
218 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.1 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1740  Glutathione S-transferase domain protein  32.69 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  31.71 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  32.02 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  32.68 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1298  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.15 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.323445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  34.31 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  31.22 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4118  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.09 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.579715 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4769  glutathione S-transferase-like  32.09 
 
 
218 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3398  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.09 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1002  glutathione S-transferase, putative  33.82 
 
 
201 aa  94.7  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  33.51 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0944  putative glutathione S-transferase  33.82 
 
 
201 aa  94  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.93 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  32.2 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  32.2 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  27.54 
 
 
216 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  32.2 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  31.71 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  28.08 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  32.2 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  31.53 
 
 
202 aa  91.7  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3341  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.7 
 
 
210 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>