More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0912 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  76.78 
 
 		 212 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  77.73 
 
 		 212 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  76.78 
 
 		 210 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  76.78 
 
 		 210 aa  307  9e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  76.3 
 
 		 210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  76.3 
 
 		 210 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  69.34 
 
 		 211 aa  300  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  64.76 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  58.29 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1191  maleylacetoacetate isomerase  62.56 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.916605  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  51.39 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  49.54 
 
 		 214 aa  208  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  53.02 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  49.07 
 
 		 212 aa  197  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  48.08 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  43.58 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  50.71 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  46.51 
 
 		 215 aa  192  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  49.06 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  46.54 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  48.13 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  48.36 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  47.17 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  49.07 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  43.95 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  46.54 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  45.29 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  48.37 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  46.36 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  46.57 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  47.44 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  48.13 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  50.24 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  45.33 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  46.98 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  46.98 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  46.98 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  45.33 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  46.98 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  46.01 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  46.01 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  46.01 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  44.44 
 
 		 212 aa  177  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  48.53 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  47.62 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  46.01 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  46.01 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  47.44 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  46.36 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  44.86 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  47.44 
 
 		 216 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  45.33 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3483  maleylacetoacetate isomerase  46.58 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  47.66 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  45.07 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  44.5 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  47.29 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  45.33 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  44.65 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  45.33 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  46.73 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  45.58 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  43.54 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  46.3 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  43.72 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  45.12 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3583  maleylacetoacetate isomerase  44.6 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  42.06 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1887  maleylacetoacetate isomerase  47.2 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  46.48 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  43.46 
 
 		 214 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  43.46 
 
 		 214 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  43.46 
 
 		 214 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  43.46 
 
 		 214 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  47.44 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4440  maleylacetoacetate isomerase  46.73 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.716277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  45.77 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  44.76 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  42.06 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  41.44 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  41.7 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1019  maleylacetoacetate isomerase  45.24 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4219  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.553079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4147  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202832  normal  0.0442189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  43.66 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3570  maleylacetoacetate isomerase  45.87 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  41.59 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3421  maleylacetoacetate isomerase  46.33 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>