More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0183 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  96.82 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  95 
 
 		 220 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  89.55 
 
 		 220 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  61.19 
 
 		 219 aa  275  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  48.18 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.76 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  45.5 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.45 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  42.31 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.09 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  40.45 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  42.03 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  41.35 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.36 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  36.7 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  40.57 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.49 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1372  Glutathione S-transferase domain  38.39 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00129076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3183  putative glutathione S-transferase  37.44 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0938037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  40.09 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  39.15 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  38.21 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  38.21 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  38.21 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.41 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  37.26 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  37.57 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.57 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.57 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.57 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.57 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  37.57 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.84 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  32.08 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  34.76 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  31.71 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  29.86 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  30.43 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  27.54 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  31.82 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  25.56 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  36.69 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.15 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  31.25 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.05 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.81 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  32.21 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  27.96 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.58 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3542  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.15 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  29.55 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0069  Glutathione S-transferase domain protein  30.25 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.39 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  27.73 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  34.58 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  34.91 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  25.55 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  29.15 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  25.76 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.09 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  31.68 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.6 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.02 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  27.37 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3884  putative glutathione S-transferase  37.63 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0796916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.29 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  31.96 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.86 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  26.86 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  28.37 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  24.77 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  27.01 
 
 		 391 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  31.96 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4069  putative glutathione S-transferase  37.63 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  31.91 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3962  putative glutathione S-transferase  37.63 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  normal  0.386103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  28.05 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.88 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4007  putative glutathione S-transferase  37.63 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.228817 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  27.57 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.32 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  29.56 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.14 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2831  maleylacetoacetate isomerase  25.64 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  29.56 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.88 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  31.78 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  27.04 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.04 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>