More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2167 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  93.55 
 
 		 217 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  83.87 
 
 		 218 aa  390  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  65.09 
 
 		 213 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  65.09 
 
 		 213 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.26 
 
 		 220 aa  258  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.43 
 
 		 214 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.52 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.48 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.34 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3183  putative glutathione S-transferase  47.6 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0938037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.52 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.52 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.52 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  49.52 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.52 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  48.61 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  47.64 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  49.52 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  47.64 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  47.17 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  47.17 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  47.69 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  47.17 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1372  Glutathione S-transferase domain  46.63 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00129076 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.25 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  46.34 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  42.01 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.31 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  42.31 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.83 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.79 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  34.62 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  28.37 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  29.81 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0706663  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  30.38 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2216  Glutathione S-transferase domain protein  31.01 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  29.73 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2208  glutathione S-transferase  26.89 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  30.38 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  30.63 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2467  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.66 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.12 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13090  Stringent starvation protein A  29.3 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  35 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  33.5 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  27.33 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2205  glutathione S-transferase-like protein  26.88 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.213168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.11 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  28.3 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  28.3 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.68 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  26.88 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  33.14 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2871  stringent starvation protein A  26.96 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  27.39 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.12 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  26.88 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  25.61 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.95 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  29.15 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0804  stringent starvation protein A  28.48 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000607549  hitchhiker  0.0080229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  25.62 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4163  stringent starvation protein A  28.66 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  27.62 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  32.57 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.88 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.68 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  28.22 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  27.15 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  28.22 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  31.64 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.35 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  26.61 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  28.66 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.41 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.61 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4529  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.25 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0754  stringent starvation protein A  28.03 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00653635  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.64 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  26.11 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  28.89 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0573  stringent starvation protein A  28.12 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.206079  normal  0.372296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>