More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6889 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  100 
 
 
391 aa  794    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.93 
 
 
215 aa  262  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  51.13 
 
 
228 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  54.55 
 
 
228 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.27 
 
 
224 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  50.93 
 
 
303 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  50.93 
 
 
303 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  50.93 
 
 
219 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  50.93 
 
 
219 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  50.93 
 
 
219 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  50.93 
 
 
219 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  50.93 
 
 
219 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  49.53 
 
 
219 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.53 
 
 
219 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  50 
 
 
219 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.53 
 
 
248 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  49.07 
 
 
219 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
219 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  48.6 
 
 
219 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  49.53 
 
 
217 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.13 
 
 
219 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.13 
 
 
217 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.13 
 
 
219 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  45.28 
 
 
218 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  47.64 
 
 
246 aa  180  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.6 
 
 
217 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.81 
 
 
226 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  45.89 
 
 
211 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.33 
 
 
219 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  44.86 
 
 
219 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  56.94 
 
 
145 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  58.52 
 
 
145 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  50.28 
 
 
246 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  55.97 
 
 
138 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  50.28 
 
 
243 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  55.22 
 
 
142 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  56.39 
 
 
141 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  57.35 
 
 
145 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  57.35 
 
 
145 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  57.35 
 
 
145 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  57.35 
 
 
145 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  57.35 
 
 
145 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  55.88 
 
 
141 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  58.21 
 
 
145 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  53.68 
 
 
143 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  54.41 
 
 
143 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
217 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  60.48 
 
 
141 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  60.48 
 
 
141 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  50 
 
 
141 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  53.73 
 
 
137 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  53.73 
 
 
143 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  51.82 
 
 
143 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
228 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  50.74 
 
 
143 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  50.74 
 
 
143 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  50.74 
 
 
143 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.94 
 
 
215 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  43.32 
 
 
220 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  51.47 
 
 
144 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  52.59 
 
 
140 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  50.38 
 
 
145 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  50.75 
 
 
140 aa  133  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.6 
 
 
215 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  49.26 
 
 
140 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  48.18 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  37.43 
 
 
215 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.43 
 
 
215 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.01 
 
 
215 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.55 
 
 
217 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.01 
 
 
215 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.18 
 
 
215 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  38.6 
 
 
215 aa  126  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.84 
 
 
215 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  37.56 
 
 
226 aa  123  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  49.6 
 
 
140 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  48.89 
 
 
139 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  48.89 
 
 
139 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  39.18 
 
 
217 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  43.8 
 
 
139 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 
215 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  42.96 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  49.22 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  48.44 
 
 
147 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  46.53 
 
 
143 aa  116  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  49.17 
 
 
147 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  44.17 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  47.2 
 
 
143 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 
216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  41.61 
 
 
145 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  43.07 
 
 
284 aa  109  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  47.11 
 
 
122 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.92 
 
 
233 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  43.08 
 
 
149 aa  99.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  44.35 
 
 
145 aa  99.8  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  42.5 
 
 
137 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  41.67 
 
 
137 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  41.67 
 
 
137 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  35.46 
 
 
146 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  45.38 
 
 
144 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>