More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1613 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  80.27 
 
 		 225 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.37 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.83 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.83 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  39.45 
 
 		 220 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  37.9 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.72 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.55 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  34.72 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  40.28 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  40.58 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  37.26 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  36.32 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.24 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  36.71 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.07 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.38 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  34.27 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  33.81 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.97 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.97 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  32.97 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.97 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.97 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  33.01 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3183  putative glutathione S-transferase  32.21 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0938037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  32.97 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  31.42 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  31.42 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1372  Glutathione S-transferase domain  32.69 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00129076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  32.23 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  30.97 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 		 210 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  25.57 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.65 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  28.65 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  30.3 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.98 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  26.32 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.2 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.02 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.98 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  27.85 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  30 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.85 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  29.19 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.96 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  26.4 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  29.29 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.7 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0409  Glutathione S-transferase domain protein  26.37 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.07 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.47 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  26.67 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.51 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  25.94 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  27.67 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  26.35 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.54 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.11 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.61 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  25.7 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.88 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  27.27 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  29.52 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  29.32 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  29.88 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  26.09 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.16 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  28.35 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4176  glutathione S-transferase-like  26.9 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  24.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  25.39 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  25.99 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  26.22 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  27.56 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  25.14 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  28 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1854  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.24 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.08 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  29.09 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  29.17 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  23.03 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  24.77 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.92 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.31 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.73 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  24.43 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  25.31 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  25.93 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  25 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  23.46 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>