More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4250 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  411  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.5 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  45.59 
 
 		 203 aa  185  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  37.44 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  35.92 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  36.41 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  35.78 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.78 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.8 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  35.29 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  35.92 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  33.49 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  35.44 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.62 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.45 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  36.32 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  32 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  33.15 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.98 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.75 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  35.75 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  37.14 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.81 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  34.76 
 
 		 212 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  34.76 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  35.43 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  37.21 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  35.47 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  38.62 
 
 		 214 aa  94.7  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  29.47 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.33 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  34.3 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  34.88 
 
 		 210 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.61 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  34.3 
 
 		 210 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.52 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  36.11 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  33.17 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  30.66 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  32.84 
 
 		 216 aa  85.9  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  34.05 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  32.96 
 
 		 215 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  34.22 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  33.68 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  31.44 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2048  maleylacetoacetate isomerase  32.97 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.52 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  32.97 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  25.37 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  32.95 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  33.52 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  29.84 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  29.14 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  32.12 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  28.86 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  31.19 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.99 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  30.92 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.36 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  30.39 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  30.92 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  31.46 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  30.5 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  27.27 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3332  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.46 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  30.81 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  34.46 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  33.65 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.29 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  34.27 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2831  maleylacetoacetate isomerase  34.81 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.86 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  29.9 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  31.12 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  34.27 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  35.08 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  29.79 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  31.64 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  28.64 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  30.73 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.02 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.3 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  30.16 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  28.35 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  30.18 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3421  maleylacetoacetate isomerase  34.25 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  30.18 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  25.99 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>