More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0253 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
220 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  90.91 
 
 
220 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  89.55 
 
 
220 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  89.55 
 
 
220 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  61.64 
 
 
219 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  47.27 
 
 
224 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.34 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  46.45 
 
 
213 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.83 
 
 
225 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  43.69 
 
 
213 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.64 
 
 
220 aa  161  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  42.93 
 
 
218 aa  160  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  42.31 
 
 
217 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  42.79 
 
 
217 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.34 
 
 
215 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1372  Glutathione S-transferase domain  40.28 
 
 
215 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00129076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3183  putative glutathione S-transferase  39.34 
 
 
215 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0938037  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  38.07 
 
 
225 aa  151  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.44 
 
 
218 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  39.62 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  38.68 
 
 
218 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  39.15 
 
 
218 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  38.32 
 
 
218 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 
218 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.79 
 
 
224 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.79 
 
 
218 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.79 
 
 
218 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  36.79 
 
 
218 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.79 
 
 
218 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  36.79 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  37.74 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  37.74 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  36.79 
 
 
218 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 
210 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  33.54 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  29.47 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  35.71 
 
 
226 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  26.75 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  30.11 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  30.34 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  27.19 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.94 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.84 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  31.13 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  26.54 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.13 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  27.07 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.07 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0177  glutathione S-transferase family protein  28.43 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0356  Glutathione S-transferase domain  28.43 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  31.76 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  29.28 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  27.85 
 
 
215 aa  62  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.15 
 
 
221 aa  62  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.26 
 
 
238 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  25.76 
 
 
221 aa  62  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  31.28 
 
 
203 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  28.9 
 
 
216 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.51 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  30.68 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  30.3 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
202 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3542  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.46 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  30.11 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  29.07 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  30.59 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4219  maleylacetoacetate isomerase  25.37 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.553079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.72 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4147  maleylacetoacetate isomerase  25.37 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202832  normal  0.0442189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  28.95 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.56 
 
 
232 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.12 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  37.14 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.64 
 
 
205 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  33.96 
 
 
214 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 
229 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  32 
 
 
206 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  25 
 
 
246 aa  58.5  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.84 
 
 
226 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  25.79 
 
 
228 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0831  glutathione S-transferase family protein  27.48 
 
 
294 aa  58.2  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  25.37 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.83 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  29.74 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.85 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  27.49 
 
 
391 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  34.74 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2348  glutathione S-transferase-like protein  32.84 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626345  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.57 
 
 
252 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2873  glutathione S-transferase-like  28.81 
 
 
256 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.480428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.55 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.44 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  36.17 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0069  Glutathione S-transferase domain protein  29.63 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.92 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  27.4 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  24.03 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  24.05 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>