More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0280 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 
215 aa  447  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  71.63 
 
 
215 aa  322  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  66.82 
 
 
214 aa  310  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  68.69 
 
 
214 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  67.76 
 
 
214 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  67.76 
 
 
214 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  67.76 
 
 
214 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  65.89 
 
 
214 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  65.89 
 
 
214 aa  299  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  66.36 
 
 
214 aa  299  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  65.89 
 
 
229 aa  299  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  65.42 
 
 
214 aa  295  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  64.95 
 
 
214 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  64.95 
 
 
214 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  64.95 
 
 
214 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  64.95 
 
 
214 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  65.33 
 
 
214 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  65.33 
 
 
214 aa  274  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  65.33 
 
 
214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  64.32 
 
 
214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  63.55 
 
 
214 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  61.03 
 
 
216 aa  267  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  58.41 
 
 
214 aa  265  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  60.09 
 
 
214 aa  264  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  60 
 
 
213 aa  259  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  60.75 
 
 
212 aa  258  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  60.28 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  57.01 
 
 
213 aa  248  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  57.4 
 
 
222 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  58.04 
 
 
222 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  57.14 
 
 
216 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  57.4 
 
 
222 aa  245  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  56.68 
 
 
216 aa  245  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  56.22 
 
 
216 aa  242  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  57.35 
 
 
216 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  56.28 
 
 
216 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  54.84 
 
 
216 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  50.94 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  54.38 
 
 
216 aa  238  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  54.38 
 
 
216 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  53.67 
 
 
216 aa  238  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  54.38 
 
 
216 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  54.21 
 
 
213 aa  238  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  54.38 
 
 
216 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  53.36 
 
 
221 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  50.69 
 
 
216 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  53.46 
 
 
216 aa  236  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  57.42 
 
 
210 aa  234  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  54.72 
 
 
216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  55.61 
 
 
221 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  52.53 
 
 
216 aa  226  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  49.77 
 
 
222 aa  225  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 
220 aa  224  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  53.6 
 
 
222 aa  224  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  51.63 
 
 
214 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  52.11 
 
 
215 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  50.7 
 
 
212 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  53.99 
 
 
217 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  54.72 
 
 
218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  50.93 
 
 
212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  50.7 
 
 
215 aa  218  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  49.77 
 
 
213 aa  216  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5152  maleylacetoacetate isomerase  53.77 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357213  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1851  maleylacetoacetate isomerase  53.05 
 
 
230 aa  214  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  51.64 
 
 
217 aa  213  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  52.31 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  50.7 
 
 
212 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  48.79 
 
 
212 aa  211  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  48.6 
 
 
212 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  51.5 
 
 
200 aa  209  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  52.58 
 
 
213 aa  208  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  48.13 
 
 
215 aa  209  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  50.23 
 
 
214 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  51.18 
 
 
214 aa  207  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1019  maleylacetoacetate isomerase  52.36 
 
 
218 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  47.34 
 
 
212 aa  205  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  48.39 
 
 
217 aa  205  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0148  maleylacetoacetate isomerase  50.47 
 
 
213 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006322 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003652  maleylacetoacetate isomerase/glutathione S-transferase  48.6 
 
 
222 aa  204  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  48.13 
 
 
220 aa  203  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  52.58 
 
 
216 aa  203  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02180  hypothetical protein  47.22 
 
 
222 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 
214 aa  201  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 
214 aa  201  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  48.83 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  49.06 
 
 
213 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  47.89 
 
 
214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  47.89 
 
 
214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  47.89 
 
 
214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50200  maleylacetoacetate isomerase  53.52 
 
 
219 aa  194  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2629  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 
216 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000227803  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4524  putative maleylpyruvate isomerase (MhbI)  49.3 
 
 
216 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141612  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  48.83 
 
 
213 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32650  putative glutathione S-transferase  46.95 
 
 
214 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298352  hitchhiker  0.000219553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 
214 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  47.85 
 
 
206 aa  192  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4440  maleylacetoacetate isomerase  49.53 
 
 
213 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.716277 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  46.23 
 
 
215 aa  191  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  48.6 
 
 
213 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>