More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1002 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  49.52 
 
 
217 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  49.53 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  49.53 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  49.06 
 
 
218 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  48.58 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3183  putative glutathione S-transferase  46.79 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0938037  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  50.24 
 
 
218 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  48.57 
 
 
217 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  48.11 
 
 
218 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.87 
 
 
215 aa  194  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.31 
 
 
218 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  48.11 
 
 
218 aa  192  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  47.96 
 
 
218 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1372  Glutathione S-transferase domain  46.33 
 
 
215 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00129076 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.96 
 
 
218 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.96 
 
 
218 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.96 
 
 
224 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.96 
 
 
218 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  48.58 
 
 
218 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  47.96 
 
 
218 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  51.15 
 
 
213 aa  191  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.03 
 
 
214 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  44.81 
 
 
224 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.36 
 
 
210 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  45.16 
 
 
213 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.57 
 
 
220 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  40.09 
 
 
220 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.51 
 
 
220 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.62 
 
 
220 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.44 
 
 
220 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  38.5 
 
 
219 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.24 
 
 
225 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  34.74 
 
 
225 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  33.64 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  27.75 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 
228 aa  72  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  30.48 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.85 
 
 
207 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3018  stringent starvation protein A  28.22 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00907689  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.84 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  27.6 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.77 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0804  stringent starvation protein A  27.61 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000607549  hitchhiker  0.0080229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  27.1 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  28.04 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  29.95 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  42.05 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  27.19 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.77 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4163  stringent starvation protein A  26.99 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527161  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2208  glutathione S-transferase  28.04 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1078  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13090  Stringent starvation protein A  29.94 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  27.01 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  30.3 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0573  stringent starvation protein A  26.99 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.206079  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  28.83 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  31.29 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  27.62 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  29.45 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  29.45 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  26.22 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  27.61 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3198  stringent starvation protein A  27.61 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3304  stringent starvation protein A  27.11 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.05 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1320  stringent starvation protein A  27.84 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264365  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.84 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2757  hypothetical protein  25.61 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.04 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3273  stringent starvation protein A  26.99 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.42421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3886  stringent starvation protein A  26.99 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0611  stringent starvation protein A  29.27 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0565  stringent starvation protein A  26.99 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000178546  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0604  stringent starvation protein A  26.99 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.202043  hitchhiker  0.000247718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4529  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0203  glutathione S-transferase-like protein  28.44 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  28.02 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3703  stringent starvation protein A  26.99 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172344  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  40.45 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  27.01 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3760  stringent starvation protein A  26.99 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000134387  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0605  stringent starvation protein A  26.99 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000737921  normal  0.076273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3425  stringent starvation protein A  26.99 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0632774  normal  0.103062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  25.71 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.7 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004506  stringent starvation protein A  30.06 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000234692  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 
200 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00886  stringent starvation protein A  30.06 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.99 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0706663  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  25.62 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  26.26 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.26 
 
 
204 aa  62  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.44 
 
 
205 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2467  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.64 
 
 
209 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4437  stringent starvation protein A  25.62 
 
 
213 aa  62  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4821  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.47 
 
 
207 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62479  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  32.2 
 
 
203 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>