More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2088 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
216 aa  430  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3332  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.24 
 
 
210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  49.06 
 
 
215 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.79 
 
 
207 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.06 
 
 
207 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  47.34 
 
 
207 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  37.98 
 
 
213 aa  154  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  41.2 
 
 
220 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  41.2 
 
 
220 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.96 
 
 
220 aa  141  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  36.7 
 
 
249 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  34.57 
 
 
249 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  33.01 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  33.49 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  32.43 
 
 
219 aa  94.7  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  31.73 
 
 
241 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  31.88 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 
225 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  30.29 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  30.88 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 
202 aa  88.2  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.68 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1508  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.34 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.29 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.82 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  25.82 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3920  putative glutathione S-transferase  33.17 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4963  putative glutathione S-transferase  33.17 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.805647  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  25.46 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  25.46 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.46 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03447  predicted glutathione S-transferase  33.17 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0116  Glutathione S-transferase domain protein  33.17 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3798  putative glutathione S-transferase  33.17 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03398  hypothetical protein  33.17 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4090  putative glutathione S-transferase  33.17 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0121  putative glutathione S-transferase  33.17 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4007  putative glutathione S-transferase  33.17 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.6966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  25 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  25 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  25 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  25 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  25 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  25 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  25 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  25 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.58 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2784  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.65 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0350061  hitchhiker  0.000562262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2741  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.92 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  25 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  25.35 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  25 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2483  glutathione S-transferase-like protein  29.95 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.478501  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  26.85 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  24.41 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  24.41 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  29.27 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  24.19 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  28.5 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  31.36 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.81 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.53 
 
 
203 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  24.19 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  25 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  24.41 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  31.36 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  27.8 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  31.36 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  31.36 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  31.36 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  30.5 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  31.36 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  31.36 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  31.36 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  24.77 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.09 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  32.68 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.52 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.25 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.25 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  29.25 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  29.35 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  29.21 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  29.65 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  31.95 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  31.1 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>