More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0557 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  454  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  40.27 
 
 
220 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.09 
 
 
220 aa  168  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  39.72 
 
 
213 aa  165  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  40.27 
 
 
220 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.48 
 
 
207 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  36.52 
 
 
249 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  37.5 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  38.73 
 
 
249 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  38.1 
 
 
207 aa  124  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.32 
 
 
207 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3332  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.87 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  32.72 
 
 
215 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  33.02 
 
 
224 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  32.56 
 
 
224 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  27.62 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  28.37 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  27.78 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.14 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.84 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  25.96 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  25 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  23.39 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.85 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  31.82 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  23.85 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  23.39 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  23.85 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.25 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  25 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.06 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  23.39 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  28.24 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  23.39 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  24.07 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  23.39 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.14 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.39 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  24.77 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  23.39 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.39 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.39 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  23.39 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  28.64 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.39 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.39 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  23.39 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  23.39 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  23.39 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  23.39 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  23.39 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  23.39 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  31.68 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  23.39 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  23.39 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  28 
 
 
224 aa  72  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  30.88 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  23 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  22.22 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  31.25 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  21.76 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  24.52 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.69 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.04 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  28.81 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.39 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  28.81 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  26.64 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  30.43 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  30.59 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.04 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.22 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  26.58 
 
 
226 aa  68.2  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  24.76 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  24.07 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  23.7 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  23.39 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  29.47 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  22.69 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  27.14 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  27.23 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  23.94 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  23.22 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  23.04 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0809  Glutathione S-transferase domain protein  35.85 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803645  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  31.05 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  24.88 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  22.58 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  25 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.58 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  28.11 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  27.98 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5254  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.17 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  28.11 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>