More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5254 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5254  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.66 
 
 		 238 aa  347  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0809  Glutathione S-transferase domain protein  58.48 
 
 		 224 aa  274  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  59.19 
 
 		 224 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  56.95 
 
 		 224 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.01 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  52.25 
 
 		 226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  52.27 
 
 		 226 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  51.36 
 
 		 227 aa  237  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.9 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  51.83 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4176  glutathione S-transferase-like  48.87 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1854  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.86 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  41.46 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  41.46 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0885  Glutathione S-transferase domain protein  38.5 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1309  glutathione S-transferase-like protein  35.85 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00711135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3979  glucose-inhibited division protein A subfamily protein  36.24 
 
 		 232 aa  131  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  34 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2049  Glutathione S-transferase domain protein  35.75 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  30.66 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.86 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  35.23 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  35.23 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  34.68 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  35.23 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  35.23 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  34.68 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  35.23 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  35.23 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  35.23 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  35.23 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  35.23 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  35.23 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  35.23 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  35.23 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  35.26 
 
 		 203 aa  89  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  34.66 
 
 		 203 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  34.66 
 
 		 203 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  34.1 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.1 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  32.16 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  32.34 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  35.84 
 
 		 203 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  30.73 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  31.53 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.26 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.95 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.53 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.95 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  31.79 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  33.53 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  33.71 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  34.68 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  34.38 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  29.25 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  30.43 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0502  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.23 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  32.5 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  32.5 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  32.53 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  35.58 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  26.94 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4347  stringent starvation protein A  34.15 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000258123  hitchhiker  0.00803988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  31.82 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0294  stringent starvation protein A  33.13 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0133166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  34.97 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  29.59 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0301  stringent starvation protein A  33.13 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00830466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  31.25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  31.25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  31.25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  31.25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  31.25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  31.25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  31.25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  31.25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  31.25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  31.25 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  31.25 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  31.25 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  31.25 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  31.25 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  30.91 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3273  stringent starvation protein A  30.9 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.42421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  29.41 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0605  stringent starvation protein A  30.34 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000737921  normal  0.076273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3425  stringent starvation protein A  30.34 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0632774  normal  0.103062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3018  stringent starvation protein A  31.48 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00907689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0604  stringent starvation protein A  30.34 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.202043  hitchhiker  0.000247718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  30.05 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3886  stringent starvation protein A  29.44 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0565  stringent starvation protein A  29.44 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000178546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>