More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1651 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
261 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  52.92 
 
 
260 aa  279  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2778  Glutathione S-transferase domain protein  54.86 
 
 
261 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  31.98 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  29.38 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  29.13 
 
 
220 aa  86.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7480  glutathione S-transferase-like protein  31.19 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.52 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1744  Glutathione S-transferase domain protein  45.1 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  30.24 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  30.24 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  30.04 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.63 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  26.67 
 
 
218 aa  79  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  27.83 
 
 
199 aa  79  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  23.47 
 
 
220 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  29.76 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2483  glutathione S-transferase-like protein  29.3 
 
 
212 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.478501  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  23.47 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.16 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.84 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0804  stringent starvation protein A  25 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000607549  hitchhiker  0.0080229 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.69 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4617  glutathione S-transferase domain-containing protein  41 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  29.69 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  32.79 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  25.76 
 
 
205 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  26.75 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  30.73 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  24.75 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  29.13 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  30.3 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  29.02 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  27.65 
 
 
221 aa  75.1  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.17 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  26.34 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  26.34 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  26.34 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5691  glutathione S-transferase domain-containing protein  42 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3273  stringent starvation protein A  24.53 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.42421  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  27.19 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  26.13 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  26.11 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  26.11 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  26.34 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  26.11 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  26.11 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  26.11 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  26.34 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4347  stringent starvation protein A  24.26 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000258123  hitchhiker  0.00803988 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  26.11 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  26.11 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  26.11 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  26.48 
 
 
209 aa  72  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3018  stringent starvation protein A  25 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00907689  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  28.14 
 
 
216 aa  72  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.11 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.11 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  26.04 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.75 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.11 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  24.75 
 
 
205 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  26.11 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.11 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  24.75 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  24.75 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  26.11 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.51 
 
 
215 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3304  stringent starvation protein A  24.53 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.11 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4163  stringent starvation protein A  24.88 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527161  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.27 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  25 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  24.76 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  24.88 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.76 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.27 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.76 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.51 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.79 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  29.73 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  25 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3703  stringent starvation protein A  22.17 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172344  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0573  stringent starvation protein A  24.06 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.206079  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0565  stringent starvation protein A  22.17 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000178546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3886  stringent starvation protein A  22.17 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3760  stringent starvation protein A  22.17 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000134387  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  30 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0605  stringent starvation protein A  23.58 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000737921  normal  0.076273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3425  stringent starvation protein A  23.58 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0632774  normal  0.103062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  26.64 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2208  glutathione S-transferase  24.07 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1078  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.24 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004506  stringent starvation protein A  26.7 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000234692  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0069  Glutathione S-transferase domain protein  26.43 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00886  stringent starvation protein A  26.7 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.63 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  26.07 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>