More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2873 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2778  Glutathione S-transferase domain protein  86.05 
 
 
261 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.92 
 
 
261 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  32.11 
 
 
203 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  32.11 
 
 
203 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  32.11 
 
 
203 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  32.62 
 
 
203 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  30.24 
 
 
220 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  30.24 
 
 
209 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  32.62 
 
 
203 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  32.62 
 
 
204 aa  92.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  31.02 
 
 
203 aa  92.4  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 
203 aa  92  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  31.05 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  31.05 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  31.05 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  31.05 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  31.05 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  31.02 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  31.05 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  31.05 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  31.05 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  31.05 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.05 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  31.02 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  31.05 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  32.8 
 
 
198 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  32.45 
 
 
199 aa  89.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  30.29 
 
 
208 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  29.21 
 
 
219 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 
204 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 
219 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.31 
 
 
228 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  29.02 
 
 
199 aa  85.9  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  33.51 
 
 
199 aa  86.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  29.9 
 
 
217 aa  85.9  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.52 
 
 
217 aa  85.9  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
203 aa  85.5  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  30.71 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  30.65 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  31.72 
 
 
198 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3018  stringent starvation protein A  30.46 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00907689  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  29.47 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  27.36 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3304  stringent starvation protein A  29.95 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  28.79 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.95 
 
 
203 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3273  stringent starvation protein A  29.7 
 
 
209 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.42421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0605  stringent starvation protein A  29.21 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000737921  normal  0.076273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3425  stringent starvation protein A  29.21 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0632774  normal  0.103062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  30 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0604  stringent starvation protein A  29.21 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.202043  hitchhiker  0.000247718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  30 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  30 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  29.65 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  30 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0565  stringent starvation protein A  29.95 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000178546  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  30 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3703  stringent starvation protein A  29.95 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172344  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  29.47 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  33.5 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  30 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3886  stringent starvation protein A  29.95 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  30 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3760  stringent starvation protein A  29.95 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000134387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  30 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.95 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  29.2 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  29.91 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7480  glutathione S-transferase-like protein  43.52 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.37 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  30 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  28.85 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  28.85 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  28.85 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  28.85 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  28.85 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.97 
 
 
267 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  28.42 
 
 
203 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  28.23 
 
 
205 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.42 
 
 
214 aa  79  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.16 
 
 
205 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2659  stringent starvation protein A  26.13 
 
 
221 aa  79  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0611  stringent starvation protein A  28.93 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  28.23 
 
 
205 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  31.53 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  28.28 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.42 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  31.88 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3198  stringent starvation protein A  29.95 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  28.42 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5691  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.06 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  34.63 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>