More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4581 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  88.57 
 
 
210 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  48.06 
 
 
209 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  47.83 
 
 
209 aa  192  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  44.93 
 
 
210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.66 
 
 
219 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  43.96 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  43.54 
 
 
215 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.76 
 
 
211 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  40.29 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  40.29 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  38.42 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  35.89 
 
 
203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.85 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.19 
 
 
206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  35.1 
 
 
208 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  34.91 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  34.62 
 
 
208 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.62 
 
 
208 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.62 
 
 
208 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.23 
 
 
205 aa  124  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.13 
 
 
208 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.23 
 
 
203 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
208 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.21 
 
 
208 aa  121  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 
206 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  32.56 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  32.09 
 
 
220 aa  115  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.92 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  31.1 
 
 
204 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  33.18 
 
 
206 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  30.62 
 
 
204 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
204 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  31.73 
 
 
203 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  29.35 
 
 
209 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  33.49 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.88 
 
 
214 aa  99  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  31.1 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.62 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.7 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1435  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.37 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53764  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  30.43 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  29.52 
 
 
226 aa  82  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.84 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2975  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.91 
 
 
234 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  26.67 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  26.13 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  45.16 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  29.86 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  43.01 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  43.01 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.54 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  28.02 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0981  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.19 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4263  glutathione S-transferase-like protein  31.16 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0748  putative glutathione S-transferase  31.82 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.206898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  27.75 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  31.86 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  37.89 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  27.27 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  39.36 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  38.71 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  38.71 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  26.61 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  26.76 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  30.39 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  40.43 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  40.43 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.86 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  39.78 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.79 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  40.43 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  25 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  31.1 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.44 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  39.36 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  24.53 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  25.24 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  38.71 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  50.6 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  26.44 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  40.86 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.44 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.17 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  31.9 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  27.75 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6524  maleylacetoacetate isomerase  41.25 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.15 
 
 
233 aa  64.7  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  38.3 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>