More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0529 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  100 
 
 
203 aa  424  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  70.44 
 
 
204 aa  309  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  68.32 
 
 
204 aa  298  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.38 
 
 
208 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.39 
 
 
208 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  61.39 
 
 
208 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.38 
 
 
208 aa  275  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.39 
 
 
208 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.39 
 
 
208 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.88 
 
 
208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  61.39 
 
 
208 aa  269  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.04 
 
 
211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.68 
 
 
210 aa  247  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  57.29 
 
 
209 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  43.56 
 
 
202 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.49 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.09 
 
 
219 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  42.08 
 
 
203 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  37.5 
 
 
215 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  40.44 
 
 
186 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  37.98 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.89 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.84 
 
 
210 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  35.58 
 
 
215 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.59 
 
 
203 aa  134  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  33.81 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  33.81 
 
 
209 aa  125  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.84 
 
 
211 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.2 
 
 
204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.34 
 
 
205 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.97 
 
 
206 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  35.61 
 
 
206 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.62 
 
 
206 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  29.56 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  30.24 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.08 
 
 
202 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  29.76 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  28.78 
 
 
203 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  28.08 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  30.05 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  30.1 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.99 
 
 
215 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.99 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  28.99 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  26.73 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  26.73 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  27.91 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.03 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  27.94 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  28.64 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.37 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  25.25 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.34 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  27.45 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6065  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  26.11 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  28.1 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  32.52 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.43 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  26.83 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3548  glutathione S-transferase  28.71 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0628604  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  28.08 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  30.05 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  29.76 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  29.56 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  27.5 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.62 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  29.58 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  29.7 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  29.19 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2712  glutathione S-transferase-like  31.68 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.56 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  28.71 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.72 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  29.13 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  28.71 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.61 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  28.08 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  27.8 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  25.98 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.8 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  28.71 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  28.71 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.17 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1329  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.85 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.630065 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  28.71 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2771  glutathione S-transferase-like protein  27.78 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260265  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.32 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  27.59 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  27.04 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  28.71 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  26.64 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.36 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2091  glutathione S-transferase-like  24.24 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00729429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  27.32 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  25.12 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>